Protein–RNA interactions for Protein: Q99614

TTC1, Tetratricopeptide repeat protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC1Q99614 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC1Q99614 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC1Q99614 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC1Q99614 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC1Q99614 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC1Q99614 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TTC1Q99614 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC1Q99614 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC1Q99614 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC1Q99614 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC1Q99614 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC1Q99614 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC1Q99614 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC1Q99614 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC1Q99614 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC1Q99614 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC1Q99614 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC1Q99614 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC1Q99614 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC1Q99614 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC1Q99614 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC1Q99614 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC1Q99614 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC1Q99614 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC1Q99614 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC1Q99614 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC1Q99614 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC1Q99614 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC1Q99614 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC1Q99614 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC1Q99614 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC1Q99614 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC1Q99614 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC1Q99614 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC1Q99614 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC1Q99614 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC1Q99614 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC1Q99614 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTC1Q99614 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTC1Q99614 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTC1Q99614 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTC1Q99614 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTC1Q99614 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTC1Q99614 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC1Q99614 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC1Q99614 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC1Q99614 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC1Q99614 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC1Q99614 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC1Q99614 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC1Q99614 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC1Q99614 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC1Q99614 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC1Q99614 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC1Q99614 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC1Q99614 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC1Q99614 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC1Q99614 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC1Q99614 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC1Q99614 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC1Q99614 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC1Q99614 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC1Q99614 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC1Q99614 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC1Q99614 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC1Q99614 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC1Q99614 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC1Q99614 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC1Q99614 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC1Q99614 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC1Q99614 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC1Q99614 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC1Q99614 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTC1Q99614 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTC1Q99614 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TTC1Q99614 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTC1Q99614 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTC1Q99614 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTC1Q99614 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTC1Q99614 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTC1Q99614 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTC1Q99614 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TTC1Q99614 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTC1Q99614 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTC1Q99614 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTC1Q99614 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC1Q99614 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC1Q99614 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC1Q99614 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC1Q99614 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC1Q99614 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC1Q99614 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC1Q99614 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC1Q99614 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC1Q99614 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC1Q99614 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC1Q99614 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC1Q99614 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC1Q99614 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC1Q99614 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.5 ms