Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ELF4Q99607 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ELF4Q99607 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ELF4Q99607 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ELF4Q99607 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ELF4Q99607 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ELF4Q99607 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ELF4Q99607 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ELF4Q99607 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ELF4Q99607 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ELF4Q99607 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ELF4Q99607 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ELF4Q99607 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ELF4Q99607 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ELF4Q99607 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ELF4Q99607 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ELF4Q99607 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ELF4Q99607 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ELF4Q99607 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ELF4Q99607 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ELF4Q99607 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ELF4Q99607 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ELF4Q99607 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ELF4Q99607 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ELF4Q99607 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ELF4Q99607 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ELF4Q99607 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ELF4Q99607 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ELF4Q99607 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ELF4Q99607 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ELF4Q99607 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ELF4Q99607 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ELF4Q99607 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ELF4Q99607 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ELF4Q99607 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ELF4Q99607 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ELF4Q99607 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ELF4Q99607 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ELF4Q99607 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ELF4Q99607 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ELF4Q99607 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ELF4Q99607 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ELF4Q99607 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ELF4Q99607 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ELF4Q99607 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ELF4Q99607 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ELF4Q99607 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ELF4Q99607 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ELF4Q99607 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ELF4Q99607 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ELF4Q99607 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ELF4Q99607 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ELF4Q99607 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ELF4Q99607 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ELF4Q99607 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ELF4Q99607 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ELF4Q99607 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ELF4Q99607 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ELF4Q99607 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ELF4Q99607 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ELF4Q99607 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ELF4Q99607 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ELF4Q99607 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ELF4Q99607 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ELF4Q99607 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ELF4Q99607 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ELF4Q99607 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ELF4Q99607 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ELF4Q99607 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ELF4Q99607 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ELF4Q99607 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ELF4Q99607 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ELF4Q99607 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ELF4Q99607 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ELF4Q99607 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ELF4Q99607 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ELF4Q99607 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ELF4Q99607 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ELF4Q99607 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ELF4Q99607 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ELF4Q99607 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ELF4Q99607 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ELF4Q99607 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ELF4Q99607 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ELF4Q99607 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ELF4Q99607 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ELF4Q99607 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ELF4Q99607 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ELF4Q99607 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ELF4Q99607 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ELF4Q99607 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ELF4Q99607 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ELF4Q99607 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ELF4Q99607 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ELF4Q99607 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ELF4Q99607 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ELF4Q99607 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ELF4Q99607 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELF4Q99607 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELF4Q99607 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms