Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POP1Q99575 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POP1Q99575 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POP1Q99575 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POP1Q99575 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POP1Q99575 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POP1Q99575 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POP1Q99575 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POP1Q99575 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POP1Q99575 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POP1Q99575 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POP1Q99575 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POP1Q99575 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POP1Q99575 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POP1Q99575 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POP1Q99575 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POP1Q99575 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POP1Q99575 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POP1Q99575 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
POP1Q99575 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POP1Q99575 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POP1Q99575 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POP1Q99575 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POP1Q99575 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POP1Q99575 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
POP1Q99575 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POP1Q99575 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POP1Q99575 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POP1Q99575 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
POP1Q99575 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
POP1Q99575 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
POP1Q99575 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
POP1Q99575 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
POP1Q99575 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
POP1Q99575 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
POP1Q99575 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
POP1Q99575 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POP1Q99575 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POP1Q99575 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POP1Q99575 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POP1Q99575 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POP1Q99575 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POP1Q99575 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
POP1Q99575 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POP1Q99575 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POP1Q99575 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POP1Q99575 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POP1Q99575 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POP1Q99575 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POP1Q99575 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POP1Q99575 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
POP1Q99575 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POP1Q99575 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POP1Q99575 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POP1Q99575 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POP1Q99575 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POP1Q99575 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POP1Q99575 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
POP1Q99575 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POP1Q99575 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POP1Q99575 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POP1Q99575 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POP1Q99575 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POP1Q99575 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POP1Q99575 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POP1Q99575 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
POP1Q99575 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
POP1Q99575 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
POP1Q99575 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
POP1Q99575 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POP1Q99575 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
POP1Q99575 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
POP1Q99575 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
POP1Q99575 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
POP1Q99575 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POP1Q99575 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POP1Q99575 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POP1Q99575 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POP1Q99575 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POP1Q99575 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POP1Q99575 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POP1Q99575 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POP1Q99575 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POP1Q99575 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
POP1Q99575 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POP1Q99575 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POP1Q99575 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POP1Q99575 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POP1Q99575 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POP1Q99575 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POP1Q99575 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POP1Q99575 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POP1Q99575 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POP1Q99575 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POP1Q99575 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POP1Q99575 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POP1Q99575 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POP1Q99575 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POP1Q99575 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
POP1Q99575 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms