Protein–RNA interactions for Protein: Q96T83

SLC9A7, Sodium/hydrogen exchanger 7, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A7Q96T83 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC9A7Q96T83 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC9A7Q96T83 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC9A7Q96T83 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC9A7Q96T83 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC9A7Q96T83 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC9A7Q96T83 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC9A7Q96T83 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC9A7Q96T83 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC9A7Q96T83 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC9A7Q96T83 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC9A7Q96T83 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC9A7Q96T83 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC9A7Q96T83 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC9A7Q96T83 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC9A7Q96T83 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC9A7Q96T83 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC9A7Q96T83 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC9A7Q96T83 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC9A7Q96T83 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC9A7Q96T83 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC9A7Q96T83 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC9A7Q96T83 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC9A7Q96T83 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC9A7Q96T83 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC9A7Q96T83 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC9A7Q96T83 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC9A7Q96T83 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC9A7Q96T83 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC9A7Q96T83 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC9A7Q96T83 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC9A7Q96T83 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC9A7Q96T83 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC9A7Q96T83 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC9A7Q96T83 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC9A7Q96T83 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC9A7Q96T83 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC9A7Q96T83 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC9A7Q96T83 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC9A7Q96T83 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC9A7Q96T83 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC9A7Q96T83 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC9A7Q96T83 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC9A7Q96T83 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC9A7Q96T83 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC9A7Q96T83 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC9A7Q96T83 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC9A7Q96T83 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC9A7Q96T83 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC9A7Q96T83 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC9A7Q96T83 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC9A7Q96T83 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC9A7Q96T83 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC9A7Q96T83 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC9A7Q96T83 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC9A7Q96T83 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC9A7Q96T83 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC9A7Q96T83 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC9A7Q96T83 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC9A7Q96T83 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC9A7Q96T83 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC9A7Q96T83 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC9A7Q96T83 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC9A7Q96T83 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC9A7Q96T83 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC9A7Q96T83 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC9A7Q96T83 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC9A7Q96T83 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC9A7Q96T83 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC9A7Q96T83 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC9A7Q96T83 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC9A7Q96T83 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC9A7Q96T83 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC9A7Q96T83 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC9A7Q96T83 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC9A7Q96T83 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC9A7Q96T83 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC9A7Q96T83 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC9A7Q96T83 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC9A7Q96T83 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC9A7Q96T83 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC9A7Q96T83 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC9A7Q96T83 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC9A7Q96T83 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC9A7Q96T83 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC9A7Q96T83 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC9A7Q96T83 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC9A7Q96T83 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC9A7Q96T83 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC9A7Q96T83 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC9A7Q96T83 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC9A7Q96T83 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC9A7Q96T83 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC9A7Q96T83 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC9A7Q96T83 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC9A7Q96T83 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC9A7Q96T83 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC9A7Q96T83 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC9A7Q96T83 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC9A7Q96T83 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms