Protein–RNA interactions for Protein: Q96SK2

TMEM209, Transmembrane protein 209, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM209Q96SK2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM209Q96SK2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM209Q96SK2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM209Q96SK2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM209Q96SK2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM209Q96SK2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM209Q96SK2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM209Q96SK2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM209Q96SK2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM209Q96SK2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM209Q96SK2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM209Q96SK2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM209Q96SK2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM209Q96SK2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM209Q96SK2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM209Q96SK2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM209Q96SK2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM209Q96SK2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM209Q96SK2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM209Q96SK2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM209Q96SK2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM209Q96SK2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM209Q96SK2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM209Q96SK2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM209Q96SK2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM209Q96SK2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM209Q96SK2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM209Q96SK2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM209Q96SK2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMEM209Q96SK2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM209Q96SK2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM209Q96SK2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM209Q96SK2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM209Q96SK2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM209Q96SK2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM209Q96SK2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM209Q96SK2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM209Q96SK2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM209Q96SK2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM209Q96SK2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM209Q96SK2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM209Q96SK2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM209Q96SK2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM209Q96SK2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM209Q96SK2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM209Q96SK2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM209Q96SK2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM209Q96SK2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM209Q96SK2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM209Q96SK2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM209Q96SK2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM209Q96SK2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM209Q96SK2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM209Q96SK2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM209Q96SK2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM209Q96SK2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM209Q96SK2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM209Q96SK2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM209Q96SK2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM209Q96SK2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM209Q96SK2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM209Q96SK2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM209Q96SK2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM209Q96SK2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM209Q96SK2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM209Q96SK2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM209Q96SK2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM209Q96SK2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM209Q96SK2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM209Q96SK2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM209Q96SK2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TMEM209Q96SK2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TMEM209Q96SK2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM209Q96SK2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM209Q96SK2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM209Q96SK2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM209Q96SK2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM209Q96SK2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM209Q96SK2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM209Q96SK2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM209Q96SK2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM209Q96SK2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM209Q96SK2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM209Q96SK2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM209Q96SK2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM209Q96SK2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM209Q96SK2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM209Q96SK2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM209Q96SK2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM209Q96SK2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM209Q96SK2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM209Q96SK2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM209Q96SK2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM209Q96SK2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM209Q96SK2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM209Q96SK2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM209Q96SK2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM209Q96SK2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM209Q96SK2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM209Q96SK2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms