Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB8

SMC6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC6Q96SB8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMC6Q96SB8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMC6Q96SB8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMC6Q96SB8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMC6Q96SB8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMC6Q96SB8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMC6Q96SB8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMC6Q96SB8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMC6Q96SB8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMC6Q96SB8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMC6Q96SB8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMC6Q96SB8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMC6Q96SB8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMC6Q96SB8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMC6Q96SB8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMC6Q96SB8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMC6Q96SB8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMC6Q96SB8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMC6Q96SB8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMC6Q96SB8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMC6Q96SB8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMC6Q96SB8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMC6Q96SB8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMC6Q96SB8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SMC6Q96SB8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SMC6Q96SB8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMC6Q96SB8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMC6Q96SB8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMC6Q96SB8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMC6Q96SB8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMC6Q96SB8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMC6Q96SB8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMC6Q96SB8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMC6Q96SB8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMC6Q96SB8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMC6Q96SB8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMC6Q96SB8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMC6Q96SB8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMC6Q96SB8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMC6Q96SB8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMC6Q96SB8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMC6Q96SB8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMC6Q96SB8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMC6Q96SB8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMC6Q96SB8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMC6Q96SB8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMC6Q96SB8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMC6Q96SB8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMC6Q96SB8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMC6Q96SB8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMC6Q96SB8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMC6Q96SB8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMC6Q96SB8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SMC6Q96SB8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMC6Q96SB8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMC6Q96SB8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMC6Q96SB8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMC6Q96SB8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMC6Q96SB8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMC6Q96SB8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMC6Q96SB8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMC6Q96SB8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMC6Q96SB8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMC6Q96SB8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMC6Q96SB8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMC6Q96SB8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC6Q96SB8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC6Q96SB8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC6Q96SB8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC6Q96SB8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC6Q96SB8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC6Q96SB8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC6Q96SB8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC6Q96SB8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SMC6Q96SB8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMC6Q96SB8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMC6Q96SB8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMC6Q96SB8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMC6Q96SB8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMC6Q96SB8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMC6Q96SB8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMC6Q96SB8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SMC6Q96SB8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMC6Q96SB8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMC6Q96SB8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMC6Q96SB8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SMC6Q96SB8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMC6Q96SB8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMC6Q96SB8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SMC6Q96SB8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC6Q96SB8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC6Q96SB8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC6Q96SB8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC6Q96SB8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC6Q96SB8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC6Q96SB8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC6Q96SB8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC6Q96SB8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC6Q96SB8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC6Q96SB8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms