Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CSRNP1Q96S65 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CSRNP1Q96S65 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CSRNP1Q96S65 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CSRNP1Q96S65 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CSRNP1Q96S65 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CSRNP1Q96S65 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CSRNP1Q96S65 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CSRNP1Q96S65 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CSRNP1Q96S65 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CSRNP1Q96S65 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CSRNP1Q96S65 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CSRNP1Q96S65 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CSRNP1Q96S65 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CSRNP1Q96S65 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CSRNP1Q96S65 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CSRNP1Q96S65 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CSRNP1Q96S65 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CSRNP1Q96S65 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CSRNP1Q96S65 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CSRNP1Q96S65 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CSRNP1Q96S65 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CSRNP1Q96S65 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CSRNP1Q96S65 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CSRNP1Q96S65 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CSRNP1Q96S65 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CSRNP1Q96S65 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CSRNP1Q96S65 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CSRNP1Q96S65 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CSRNP1Q96S65 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CSRNP1Q96S65 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CSRNP1Q96S65 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CSRNP1Q96S65 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CSRNP1Q96S65 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CSRNP1Q96S65 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CSRNP1Q96S65 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CSRNP1Q96S65 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CSRNP1Q96S65 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CSRNP1Q96S65 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CSRNP1Q96S65 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CSRNP1Q96S65 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CSRNP1Q96S65 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CSRNP1Q96S65 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CSRNP1Q96S65 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CSRNP1Q96S65 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CSRNP1Q96S65 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CSRNP1Q96S65 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CSRNP1Q96S65 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CSRNP1Q96S65 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CSRNP1Q96S65 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CSRNP1Q96S65 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CSRNP1Q96S65 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CSRNP1Q96S65 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CSRNP1Q96S65 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CSRNP1Q96S65 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CSRNP1Q96S65 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CSRNP1Q96S65 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CSRNP1Q96S65 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CSRNP1Q96S65 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CSRNP1Q96S65 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CSRNP1Q96S65 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CSRNP1Q96S65 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CSRNP1Q96S65 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CSRNP1Q96S65 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CSRNP1Q96S65 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CSRNP1Q96S65 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CSRNP1Q96S65 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CSRNP1Q96S65 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CSRNP1Q96S65 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CSRNP1Q96S65 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CSRNP1Q96S65 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CSRNP1Q96S65 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CSRNP1Q96S65 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CSRNP1Q96S65 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CSRNP1Q96S65 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CSRNP1Q96S65 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CSRNP1Q96S65 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CSRNP1Q96S65 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CSRNP1Q96S65 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CSRNP1Q96S65 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CSRNP1Q96S65 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CSRNP1Q96S65 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CSRNP1Q96S65 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CSRNP1Q96S65 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CSRNP1Q96S65 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CSRNP1Q96S65 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CSRNP1Q96S65 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CSRNP1Q96S65 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CSRNP1Q96S65 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CSRNP1Q96S65 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CSRNP1Q96S65 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CSRNP1Q96S65 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CSRNP1Q96S65 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CSRNP1Q96S65 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CSRNP1Q96S65 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CSRNP1Q96S65 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CSRNP1Q96S65 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CSRNP1Q96S65 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CSRNP1Q96S65 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CSRNP1Q96S65 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms