Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX18Q96RF0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX18Q96RF0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX18Q96RF0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX18Q96RF0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX18Q96RF0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX18Q96RF0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX18Q96RF0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX18Q96RF0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX18Q96RF0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX18Q96RF0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX18Q96RF0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX18Q96RF0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX18Q96RF0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX18Q96RF0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX18Q96RF0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX18Q96RF0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX18Q96RF0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX18Q96RF0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX18Q96RF0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX18Q96RF0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX18Q96RF0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX18Q96RF0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX18Q96RF0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX18Q96RF0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX18Q96RF0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX18Q96RF0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX18Q96RF0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX18Q96RF0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX18Q96RF0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX18Q96RF0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX18Q96RF0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX18Q96RF0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX18Q96RF0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX18Q96RF0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX18Q96RF0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX18Q96RF0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX18Q96RF0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX18Q96RF0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX18Q96RF0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX18Q96RF0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX18Q96RF0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX18Q96RF0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX18Q96RF0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX18Q96RF0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX18Q96RF0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX18Q96RF0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX18Q96RF0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX18Q96RF0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX18Q96RF0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX18Q96RF0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX18Q96RF0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX18Q96RF0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX18Q96RF0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX18Q96RF0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX18Q96RF0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX18Q96RF0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX18Q96RF0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX18Q96RF0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX18Q96RF0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX18Q96RF0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX18Q96RF0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX18Q96RF0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX18Q96RF0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX18Q96RF0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX18Q96RF0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX18Q96RF0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX18Q96RF0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX18Q96RF0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX18Q96RF0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX18Q96RF0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX18Q96RF0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX18Q96RF0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX18Q96RF0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX18Q96RF0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX18Q96RF0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX18Q96RF0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX18Q96RF0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX18Q96RF0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX18Q96RF0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX18Q96RF0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX18Q96RF0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX18Q96RF0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX18Q96RF0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX18Q96RF0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX18Q96RF0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX18Q96RF0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX18Q96RF0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX18Q96RF0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX18Q96RF0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX18Q96RF0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX18Q96RF0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX18Q96RF0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX18Q96RF0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX18Q96RF0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX18Q96RF0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX18Q96RF0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX18Q96RF0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX18Q96RF0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX18Q96RF0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 855.5 ms