Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC85AQ96PX6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC85AQ96PX6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC85AQ96PX6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC85AQ96PX6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC85AQ96PX6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC85AQ96PX6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC85AQ96PX6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC85AQ96PX6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC85AQ96PX6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC85AQ96PX6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC85AQ96PX6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC85AQ96PX6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC85AQ96PX6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC85AQ96PX6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC85AQ96PX6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC85AQ96PX6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC85AQ96PX6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC85AQ96PX6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC85AQ96PX6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC85AQ96PX6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC85AQ96PX6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC85AQ96PX6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC85AQ96PX6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC85AQ96PX6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC85AQ96PX6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC85AQ96PX6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC85AQ96PX6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC85AQ96PX6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC85AQ96PX6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC85AQ96PX6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC85AQ96PX6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC85AQ96PX6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC85AQ96PX6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC85AQ96PX6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC85AQ96PX6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC85AQ96PX6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC85AQ96PX6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC85AQ96PX6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC85AQ96PX6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC85AQ96PX6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC85AQ96PX6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC85AQ96PX6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC85AQ96PX6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC85AQ96PX6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC85AQ96PX6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC85AQ96PX6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC85AQ96PX6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC85AQ96PX6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC85AQ96PX6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC85AQ96PX6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC85AQ96PX6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC85AQ96PX6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC85AQ96PX6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC85AQ96PX6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC85AQ96PX6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC85AQ96PX6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC85AQ96PX6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC85AQ96PX6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC85AQ96PX6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC85AQ96PX6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC85AQ96PX6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC85AQ96PX6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC85AQ96PX6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC85AQ96PX6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC85AQ96PX6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC85AQ96PX6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC85AQ96PX6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC85AQ96PX6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC85AQ96PX6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC85AQ96PX6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC85AQ96PX6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC85AQ96PX6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC85AQ96PX6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC85AQ96PX6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC85AQ96PX6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC85AQ96PX6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC85AQ96PX6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC85AQ96PX6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC85AQ96PX6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC85AQ96PX6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC85AQ96PX6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC85AQ96PX6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC85AQ96PX6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC85AQ96PX6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC85AQ96PX6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC85AQ96PX6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC85AQ96PX6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC85AQ96PX6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC85AQ96PX6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC85AQ96PX6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC85AQ96PX6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC85AQ96PX6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC85AQ96PX6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC85AQ96PX6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC85AQ96PX6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC85AQ96PX6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC85AQ96PX6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC85AQ96PX6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC85AQ96PX6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms