Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA2

RILP, Rab-interacting lysosomal protein, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RILPQ96NA2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RILPQ96NA2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RILPQ96NA2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RILPQ96NA2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RILPQ96NA2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RILPQ96NA2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RILPQ96NA2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RILPQ96NA2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RILPQ96NA2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RILPQ96NA2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RILPQ96NA2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RILPQ96NA2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RILPQ96NA2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RILPQ96NA2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RILPQ96NA2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RILPQ96NA2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RILPQ96NA2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RILPQ96NA2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RILPQ96NA2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RILPQ96NA2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RILPQ96NA2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RILPQ96NA2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RILPQ96NA2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RILPQ96NA2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RILPQ96NA2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RILPQ96NA2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RILPQ96NA2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RILPQ96NA2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RILPQ96NA2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RILPQ96NA2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RILPQ96NA2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RILPQ96NA2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RILPQ96NA2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RILPQ96NA2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RILPQ96NA2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RILPQ96NA2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RILPQ96NA2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RILPQ96NA2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RILPQ96NA2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RILPQ96NA2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RILPQ96NA2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RILPQ96NA2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RILPQ96NA2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RILPQ96NA2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RILPQ96NA2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RILPQ96NA2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RILPQ96NA2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RILPQ96NA2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RILPQ96NA2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RILPQ96NA2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RILPQ96NA2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RILPQ96NA2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RILPQ96NA2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RILPQ96NA2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RILPQ96NA2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RILPQ96NA2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RILPQ96NA2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RILPQ96NA2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RILPQ96NA2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RILPQ96NA2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RILPQ96NA2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RILPQ96NA2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RILPQ96NA2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RILPQ96NA2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RILPQ96NA2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RILPQ96NA2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RILPQ96NA2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RILPQ96NA2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RILPQ96NA2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RILPQ96NA2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RILPQ96NA2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RILPQ96NA2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RILPQ96NA2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RILPQ96NA2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RILPQ96NA2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RILPQ96NA2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RILPQ96NA2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RILPQ96NA2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RILPQ96NA2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RILPQ96NA2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RILPQ96NA2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RILPQ96NA2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RILPQ96NA2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RILPQ96NA2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RILPQ96NA2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RILPQ96NA2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RILPQ96NA2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RILPQ96NA2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RILPQ96NA2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RILPQ96NA2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RILPQ96NA2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RILPQ96NA2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RILPQ96NA2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RILPQ96NA2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RILPQ96NA2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms