Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC74BQ96LY2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC74BQ96LY2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC74BQ96LY2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC74BQ96LY2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC74BQ96LY2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC74BQ96LY2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC74BQ96LY2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC74BQ96LY2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC74BQ96LY2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC74BQ96LY2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC74BQ96LY2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC74BQ96LY2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC74BQ96LY2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC74BQ96LY2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC74BQ96LY2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC74BQ96LY2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC74BQ96LY2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC74BQ96LY2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC74BQ96LY2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC74BQ96LY2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC74BQ96LY2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC74BQ96LY2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC74BQ96LY2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC74BQ96LY2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC74BQ96LY2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC74BQ96LY2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC74BQ96LY2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC74BQ96LY2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC74BQ96LY2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC74BQ96LY2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC74BQ96LY2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC74BQ96LY2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC74BQ96LY2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC74BQ96LY2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC74BQ96LY2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC74BQ96LY2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC74BQ96LY2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC74BQ96LY2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC74BQ96LY2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC74BQ96LY2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC74BQ96LY2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC74BQ96LY2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC74BQ96LY2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC74BQ96LY2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC74BQ96LY2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC74BQ96LY2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC74BQ96LY2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC74BQ96LY2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC74BQ96LY2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC74BQ96LY2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC74BQ96LY2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC74BQ96LY2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC74BQ96LY2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC74BQ96LY2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC74BQ96LY2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC74BQ96LY2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC74BQ96LY2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC74BQ96LY2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC74BQ96LY2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC74BQ96LY2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC74BQ96LY2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC74BQ96LY2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC74BQ96LY2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC74BQ96LY2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC74BQ96LY2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC74BQ96LY2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC74BQ96LY2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC74BQ96LY2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC74BQ96LY2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC74BQ96LY2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC74BQ96LY2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC74BQ96LY2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC74BQ96LY2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC74BQ96LY2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC74BQ96LY2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC74BQ96LY2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC74BQ96LY2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC74BQ96LY2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC74BQ96LY2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC74BQ96LY2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC74BQ96LY2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC74BQ96LY2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC74BQ96LY2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC74BQ96LY2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC74BQ96LY2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC74BQ96LY2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC74BQ96LY2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC74BQ96LY2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC74BQ96LY2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC74BQ96LY2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC74BQ96LY2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC74BQ96LY2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC74BQ96LY2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC74BQ96LY2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC74BQ96LY2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC74BQ96LY2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC74BQ96LY2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC74BQ96LY2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC74BQ96LY2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms