Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX1

C4orf36, Uncharacterized protein C4orf36, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf36Q96KX1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C4orf36Q96KX1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C4orf36Q96KX1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C4orf36Q96KX1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C4orf36Q96KX1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C4orf36Q96KX1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C4orf36Q96KX1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
C4orf36Q96KX1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
C4orf36Q96KX1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C4orf36Q96KX1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C4orf36Q96KX1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C4orf36Q96KX1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C4orf36Q96KX1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C4orf36Q96KX1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C4orf36Q96KX1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C4orf36Q96KX1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C4orf36Q96KX1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C4orf36Q96KX1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C4orf36Q96KX1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
C4orf36Q96KX1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C4orf36Q96KX1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
C4orf36Q96KX1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
C4orf36Q96KX1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
C4orf36Q96KX1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C4orf36Q96KX1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C4orf36Q96KX1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4orf36Q96KX1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4orf36Q96KX1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4orf36Q96KX1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4orf36Q96KX1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4orf36Q96KX1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4orf36Q96KX1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4orf36Q96KX1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4orf36Q96KX1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4orf36Q96KX1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4orf36Q96KX1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4orf36Q96KX1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C4orf36Q96KX1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C4orf36Q96KX1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C4orf36Q96KX1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C4orf36Q96KX1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C4orf36Q96KX1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C4orf36Q96KX1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C4orf36Q96KX1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C4orf36Q96KX1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C4orf36Q96KX1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C4orf36Q96KX1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C4orf36Q96KX1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C4orf36Q96KX1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C4orf36Q96KX1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C4orf36Q96KX1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C4orf36Q96KX1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C4orf36Q96KX1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C4orf36Q96KX1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C4orf36Q96KX1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C4orf36Q96KX1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C4orf36Q96KX1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C4orf36Q96KX1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C4orf36Q96KX1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C4orf36Q96KX1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C4orf36Q96KX1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
C4orf36Q96KX1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C4orf36Q96KX1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C4orf36Q96KX1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C4orf36Q96KX1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C4orf36Q96KX1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C4orf36Q96KX1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C4orf36Q96KX1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C4orf36Q96KX1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C4orf36Q96KX1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C4orf36Q96KX1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C4orf36Q96KX1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C4orf36Q96KX1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C4orf36Q96KX1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C4orf36Q96KX1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4orf36Q96KX1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4orf36Q96KX1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4orf36Q96KX1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4orf36Q96KX1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4orf36Q96KX1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4orf36Q96KX1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4orf36Q96KX1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4orf36Q96KX1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4orf36Q96KX1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4orf36Q96KX1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4orf36Q96KX1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
C4orf36Q96KX1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4orf36Q96KX1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4orf36Q96KX1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4orf36Q96KX1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4orf36Q96KX1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4orf36Q96KX1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4orf36Q96KX1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4orf36Q96KX1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4orf36Q96KX1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C4orf36Q96KX1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C4orf36Q96KX1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C4orf36Q96KX1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C4orf36Q96KX1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C4orf36Q96KX1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms