Protein–RNA interactions for Protein: Q96G28

CFAP36, Cilia- and flagella-associated protein 36, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP36Q96G28 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP36Q96G28 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP36Q96G28 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP36Q96G28 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP36Q96G28 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP36Q96G28 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP36Q96G28 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP36Q96G28 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP36Q96G28 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP36Q96G28 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP36Q96G28 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP36Q96G28 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP36Q96G28 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP36Q96G28 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP36Q96G28 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP36Q96G28 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP36Q96G28 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP36Q96G28 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP36Q96G28 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP36Q96G28 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP36Q96G28 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP36Q96G28 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP36Q96G28 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP36Q96G28 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP36Q96G28 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP36Q96G28 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP36Q96G28 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP36Q96G28 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP36Q96G28 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP36Q96G28 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP36Q96G28 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP36Q96G28 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP36Q96G28 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP36Q96G28 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CFAP36Q96G28 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CFAP36Q96G28 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CFAP36Q96G28 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CFAP36Q96G28 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CFAP36Q96G28 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP36Q96G28 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP36Q96G28 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP36Q96G28 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP36Q96G28 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP36Q96G28 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP36Q96G28 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP36Q96G28 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP36Q96G28 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP36Q96G28 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP36Q96G28 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP36Q96G28 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP36Q96G28 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP36Q96G28 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP36Q96G28 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP36Q96G28 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP36Q96G28 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP36Q96G28 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP36Q96G28 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP36Q96G28 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP36Q96G28 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP36Q96G28 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP36Q96G28 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP36Q96G28 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP36Q96G28 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP36Q96G28 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP36Q96G28 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP36Q96G28 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP36Q96G28 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP36Q96G28 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP36Q96G28 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP36Q96G28 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP36Q96G28 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP36Q96G28 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP36Q96G28 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP36Q96G28 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CFAP36Q96G28 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CFAP36Q96G28 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CFAP36Q96G28 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP36Q96G28 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP36Q96G28 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP36Q96G28 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP36Q96G28 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP36Q96G28 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP36Q96G28 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP36Q96G28 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP36Q96G28 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP36Q96G28 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP36Q96G28 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP36Q96G28 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP36Q96G28 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP36Q96G28 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP36Q96G28 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP36Q96G28 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP36Q96G28 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP36Q96G28 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP36Q96G28 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP36Q96G28 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP36Q96G28 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP36Q96G28 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP36Q96G28 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP36Q96G28 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms