Protein–RNA interactions for Protein: Q96E14

RMI2, RecQ-mediated genome instability protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMI2Q96E14 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RMI2Q96E14 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RMI2Q96E14 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RMI2Q96E14 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RMI2Q96E14 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RMI2Q96E14 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RMI2Q96E14 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RMI2Q96E14 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RMI2Q96E14 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RMI2Q96E14 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RMI2Q96E14 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RMI2Q96E14 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RMI2Q96E14 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RMI2Q96E14 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RMI2Q96E14 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RMI2Q96E14 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RMI2Q96E14 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RMI2Q96E14 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RMI2Q96E14 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RMI2Q96E14 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RMI2Q96E14 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RMI2Q96E14 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RMI2Q96E14 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RMI2Q96E14 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RMI2Q96E14 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RMI2Q96E14 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RMI2Q96E14 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RMI2Q96E14 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RMI2Q96E14 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RMI2Q96E14 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RMI2Q96E14 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RMI2Q96E14 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RMI2Q96E14 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RMI2Q96E14 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms