Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C18orf8Q96DM3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C18orf8Q96DM3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C18orf8Q96DM3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C18orf8Q96DM3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C18orf8Q96DM3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C18orf8Q96DM3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C18orf8Q96DM3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C18orf8Q96DM3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C18orf8Q96DM3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C18orf8Q96DM3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C18orf8Q96DM3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C18orf8Q96DM3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C18orf8Q96DM3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C18orf8Q96DM3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C18orf8Q96DM3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C18orf8Q96DM3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C18orf8Q96DM3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
C18orf8Q96DM3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C18orf8Q96DM3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C18orf8Q96DM3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
C18orf8Q96DM3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
C18orf8Q96DM3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C18orf8Q96DM3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C18orf8Q96DM3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C18orf8Q96DM3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
C18orf8Q96DM3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C18orf8Q96DM3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C18orf8Q96DM3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C18orf8Q96DM3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C18orf8Q96DM3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C18orf8Q96DM3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C18orf8Q96DM3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C18orf8Q96DM3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C18orf8Q96DM3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C18orf8Q96DM3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C18orf8Q96DM3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C18orf8Q96DM3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C18orf8Q96DM3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C18orf8Q96DM3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C18orf8Q96DM3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C18orf8Q96DM3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C18orf8Q96DM3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C18orf8Q96DM3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C18orf8Q96DM3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C18orf8Q96DM3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C18orf8Q96DM3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C18orf8Q96DM3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C18orf8Q96DM3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C18orf8Q96DM3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C18orf8Q96DM3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C18orf8Q96DM3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C18orf8Q96DM3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C18orf8Q96DM3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C18orf8Q96DM3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C18orf8Q96DM3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C18orf8Q96DM3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C18orf8Q96DM3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C18orf8Q96DM3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C18orf8Q96DM3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C18orf8Q96DM3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C18orf8Q96DM3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C18orf8Q96DM3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C18orf8Q96DM3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C18orf8Q96DM3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C18orf8Q96DM3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C18orf8Q96DM3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C18orf8Q96DM3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C18orf8Q96DM3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C18orf8Q96DM3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C18orf8Q96DM3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C18orf8Q96DM3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C18orf8Q96DM3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
C18orf8Q96DM3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C18orf8Q96DM3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C18orf8Q96DM3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C18orf8Q96DM3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C18orf8Q96DM3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C18orf8Q96DM3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C18orf8Q96DM3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C18orf8Q96DM3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C18orf8Q96DM3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
C18orf8Q96DM3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C18orf8Q96DM3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C18orf8Q96DM3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C18orf8Q96DM3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C18orf8Q96DM3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C18orf8Q96DM3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
C18orf8Q96DM3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C18orf8Q96DM3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C18orf8Q96DM3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C18orf8Q96DM3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C18orf8Q96DM3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C18orf8Q96DM3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C18orf8Q96DM3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C18orf8Q96DM3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C18orf8Q96DM3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C18orf8Q96DM3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C18orf8Q96DM3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
C18orf8Q96DM3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms