Protein–RNA interactions for Protein: Q969Y0

NXPE3, NXPE family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE3Q969Y0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NXPE3Q969Y0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NXPE3Q969Y0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NXPE3Q969Y0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NXPE3Q969Y0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NXPE3Q969Y0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NXPE3Q969Y0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NXPE3Q969Y0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NXPE3Q969Y0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NXPE3Q969Y0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NXPE3Q969Y0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NXPE3Q969Y0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NXPE3Q969Y0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NXPE3Q969Y0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NXPE3Q969Y0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NXPE3Q969Y0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NXPE3Q969Y0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NXPE3Q969Y0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NXPE3Q969Y0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NXPE3Q969Y0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NXPE3Q969Y0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NXPE3Q969Y0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NXPE3Q969Y0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NXPE3Q969Y0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NXPE3Q969Y0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NXPE3Q969Y0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NXPE3Q969Y0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NXPE3Q969Y0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NXPE3Q969Y0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NXPE3Q969Y0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NXPE3Q969Y0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NXPE3Q969Y0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NXPE3Q969Y0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NXPE3Q969Y0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NXPE3Q969Y0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NXPE3Q969Y0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NXPE3Q969Y0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NXPE3Q969Y0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NXPE3Q969Y0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NXPE3Q969Y0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NXPE3Q969Y0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NXPE3Q969Y0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NXPE3Q969Y0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NXPE3Q969Y0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NXPE3Q969Y0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NXPE3Q969Y0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NXPE3Q969Y0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NXPE3Q969Y0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NXPE3Q969Y0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NXPE3Q969Y0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NXPE3Q969Y0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NXPE3Q969Y0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NXPE3Q969Y0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NXPE3Q969Y0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NXPE3Q969Y0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NXPE3Q969Y0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NXPE3Q969Y0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NXPE3Q969Y0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NXPE3Q969Y0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NXPE3Q969Y0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NXPE3Q969Y0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NXPE3Q969Y0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NXPE3Q969Y0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NXPE3Q969Y0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NXPE3Q969Y0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NXPE3Q969Y0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NXPE3Q969Y0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NXPE3Q969Y0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NXPE3Q969Y0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NXPE3Q969Y0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NXPE3Q969Y0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NXPE3Q969Y0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NXPE3Q969Y0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NXPE3Q969Y0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NXPE3Q969Y0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NXPE3Q969Y0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NXPE3Q969Y0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NXPE3Q969Y0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NXPE3Q969Y0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NXPE3Q969Y0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NXPE3Q969Y0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NXPE3Q969Y0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NXPE3Q969Y0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NXPE3Q969Y0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NXPE3Q969Y0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NXPE3Q969Y0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NXPE3Q969Y0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NXPE3Q969Y0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NXPE3Q969Y0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NXPE3Q969Y0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NXPE3Q969Y0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NXPE3Q969Y0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NXPE3Q969Y0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NXPE3Q969Y0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NXPE3Q969Y0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NXPE3Q969Y0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NXPE3Q969Y0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NXPE3Q969Y0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NXPE3Q969Y0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NXPE3Q969Y0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms