Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF3C6Q969F1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF3C6Q969F1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF3C6Q969F1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF3C6Q969F1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF3C6Q969F1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF3C6Q969F1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF3C6Q969F1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF3C6Q969F1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GTF3C6Q969F1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GTF3C6Q969F1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GTF3C6Q969F1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GTF3C6Q969F1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GTF3C6Q969F1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
GTF3C6Q969F1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GTF3C6Q969F1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GTF3C6Q969F1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GTF3C6Q969F1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GTF3C6Q969F1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GTF3C6Q969F1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF3C6Q969F1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF3C6Q969F1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF3C6Q969F1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF3C6Q969F1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF3C6Q969F1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF3C6Q969F1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF3C6Q969F1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF3C6Q969F1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF3C6Q969F1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF3C6Q969F1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF3C6Q969F1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF3C6Q969F1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF3C6Q969F1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF3C6Q969F1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF3C6Q969F1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF3C6Q969F1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF3C6Q969F1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF3C6Q969F1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF3C6Q969F1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF3C6Q969F1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GTF3C6Q969F1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GTF3C6Q969F1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GTF3C6Q969F1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GTF3C6Q969F1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GTF3C6Q969F1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GTF3C6Q969F1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GTF3C6Q969F1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTF3C6Q969F1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTF3C6Q969F1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTF3C6Q969F1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTF3C6Q969F1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
GTF3C6Q969F1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTF3C6Q969F1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTF3C6Q969F1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTF3C6Q969F1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTF3C6Q969F1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GTF3C6Q969F1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GTF3C6Q969F1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF3C6Q969F1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF3C6Q969F1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF3C6Q969F1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF3C6Q969F1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF3C6Q969F1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF3C6Q969F1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF3C6Q969F1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF3C6Q969F1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF3C6Q969F1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF3C6Q969F1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF3C6Q969F1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GTF3C6Q969F1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GTF3C6Q969F1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GTF3C6Q969F1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GTF3C6Q969F1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GTF3C6Q969F1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GTF3C6Q969F1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GTF3C6Q969F1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GTF3C6Q969F1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GTF3C6Q969F1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GTF3C6Q969F1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GTF3C6Q969F1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
GTF3C6Q969F1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF3C6Q969F1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF3C6Q969F1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF3C6Q969F1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF3C6Q969F1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GTF3C6Q969F1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GTF3C6Q969F1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GTF3C6Q969F1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GTF3C6Q969F1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF3C6Q969F1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF3C6Q969F1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF3C6Q969F1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF3C6Q969F1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF3C6Q969F1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF3C6Q969F1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF3C6Q969F1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF3C6Q969F1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTF3C6Q969F1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTF3C6Q969F1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTF3C6Q969F1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms