Protein–RNA interactions for Protein: Q92772

CDKL2, Cyclin-dependent kinase-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL2Q92772 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDKL2Q92772 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDKL2Q92772 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDKL2Q92772 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDKL2Q92772 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDKL2Q92772 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDKL2Q92772 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDKL2Q92772 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDKL2Q92772 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDKL2Q92772 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDKL2Q92772 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDKL2Q92772 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDKL2Q92772 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDKL2Q92772 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDKL2Q92772 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDKL2Q92772 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDKL2Q92772 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDKL2Q92772 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDKL2Q92772 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDKL2Q92772 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDKL2Q92772 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDKL2Q92772 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDKL2Q92772 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDKL2Q92772 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CDKL2Q92772 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDKL2Q92772 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDKL2Q92772 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDKL2Q92772 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDKL2Q92772 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDKL2Q92772 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDKL2Q92772 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDKL2Q92772 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDKL2Q92772 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDKL2Q92772 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDKL2Q92772 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDKL2Q92772 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDKL2Q92772 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDKL2Q92772 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDKL2Q92772 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDKL2Q92772 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDKL2Q92772 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDKL2Q92772 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDKL2Q92772 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDKL2Q92772 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDKL2Q92772 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKL2Q92772 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKL2Q92772 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKL2Q92772 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKL2Q92772 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKL2Q92772 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKL2Q92772 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKL2Q92772 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDKL2Q92772 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDKL2Q92772 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDKL2Q92772 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CDKL2Q92772 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDKL2Q92772 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDKL2Q92772 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDKL2Q92772 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDKL2Q92772 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKL2Q92772 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKL2Q92772 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKL2Q92772 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKL2Q92772 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKL2Q92772 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKL2Q92772 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKL2Q92772 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKL2Q92772 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKL2Q92772 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDKL2Q92772 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDKL2Q92772 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDKL2Q92772 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDKL2Q92772 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CDKL2Q92772 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDKL2Q92772 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDKL2Q92772 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDKL2Q92772 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDKL2Q92772 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDKL2Q92772 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDKL2Q92772 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDKL2Q92772 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDKL2Q92772 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDKL2Q92772 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDKL2Q92772 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDKL2Q92772 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDKL2Q92772 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDKL2Q92772 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDKL2Q92772 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms