Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBXN4Q92575 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBXN4Q92575 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBXN4Q92575 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBXN4Q92575 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBXN4Q92575 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBXN4Q92575 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
UBXN4Q92575 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBXN4Q92575 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBXN4Q92575 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBXN4Q92575 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBXN4Q92575 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBXN4Q92575 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBXN4Q92575 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBXN4Q92575 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBXN4Q92575 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
UBXN4Q92575 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
UBXN4Q92575 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
UBXN4Q92575 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
UBXN4Q92575 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBXN4Q92575 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBXN4Q92575 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBXN4Q92575 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBXN4Q92575 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBXN4Q92575 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBXN4Q92575 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBXN4Q92575 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBXN4Q92575 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBXN4Q92575 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBXN4Q92575 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
UBXN4Q92575 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBXN4Q92575 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBXN4Q92575 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBXN4Q92575 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBXN4Q92575 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBXN4Q92575 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBXN4Q92575 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
UBXN4Q92575 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBXN4Q92575 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBXN4Q92575 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBXN4Q92575 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBXN4Q92575 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBXN4Q92575 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBXN4Q92575 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBXN4Q92575 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBXN4Q92575 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBXN4Q92575 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
UBXN4Q92575 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBXN4Q92575 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBXN4Q92575 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBXN4Q92575 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBXN4Q92575 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBXN4Q92575 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBXN4Q92575 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBXN4Q92575 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBXN4Q92575 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBXN4Q92575 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBXN4Q92575 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBXN4Q92575 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
UBXN4Q92575 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBXN4Q92575 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBXN4Q92575 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBXN4Q92575 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBXN4Q92575 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBXN4Q92575 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBXN4Q92575 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBXN4Q92575 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBXN4Q92575 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBXN4Q92575 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBXN4Q92575 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBXN4Q92575 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBXN4Q92575 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBXN4Q92575 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBXN4Q92575 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBXN4Q92575 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBXN4Q92575 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBXN4Q92575 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBXN4Q92575 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBXN4Q92575 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBXN4Q92575 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBXN4Q92575 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBXN4Q92575 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBXN4Q92575 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBXN4Q92575 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBXN4Q92575 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBXN4Q92575 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBXN4Q92575 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBXN4Q92575 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBXN4Q92575 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBXN4Q92575 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBXN4Q92575 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBXN4Q92575 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBXN4Q92575 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBXN4Q92575 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBXN4Q92575 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBXN4Q92575 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBXN4Q92575 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBXN4Q92575 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBXN4Q92575 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBXN4Q92575 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms