Protein–RNA interactions for Protein: Q92570

NR4A3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A3Q92570 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR4A3Q92570 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR4A3Q92570 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NR4A3Q92570 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NR4A3Q92570 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR4A3Q92570 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR4A3Q92570 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR4A3Q92570 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR4A3Q92570 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR4A3Q92570 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR4A3Q92570 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NR4A3Q92570 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR4A3Q92570 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR4A3Q92570 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR4A3Q92570 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR4A3Q92570 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR4A3Q92570 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR4A3Q92570 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR4A3Q92570 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NR4A3Q92570 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR4A3Q92570 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR4A3Q92570 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR4A3Q92570 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR4A3Q92570 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR4A3Q92570 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NR4A3Q92570 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR4A3Q92570 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR4A3Q92570 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR4A3Q92570 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NR4A3Q92570 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR4A3Q92570 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR4A3Q92570 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NR4A3Q92570 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR4A3Q92570 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR4A3Q92570 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR4A3Q92570 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR4A3Q92570 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR4A3Q92570 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR4A3Q92570 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NR4A3Q92570 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR4A3Q92570 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR4A3Q92570 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR4A3Q92570 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR4A3Q92570 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR4A3Q92570 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR4A3Q92570 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR4A3Q92570 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR4A3Q92570 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR4A3Q92570 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR4A3Q92570 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR4A3Q92570 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR4A3Q92570 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR4A3Q92570 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR4A3Q92570 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR4A3Q92570 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR4A3Q92570 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR4A3Q92570 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR4A3Q92570 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR4A3Q92570 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR4A3Q92570 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR4A3Q92570 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR4A3Q92570 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR4A3Q92570 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NR4A3Q92570 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR4A3Q92570 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR4A3Q92570 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR4A3Q92570 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR4A3Q92570 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR4A3Q92570 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR4A3Q92570 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR4A3Q92570 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR4A3Q92570 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NR4A3Q92570 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR4A3Q92570 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR4A3Q92570 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR4A3Q92570 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NR4A3Q92570 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR4A3Q92570 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR4A3Q92570 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR4A3Q92570 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR4A3Q92570 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR4A3Q92570 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR4A3Q92570 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR4A3Q92570 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR4A3Q92570 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR4A3Q92570 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR4A3Q92570 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR4A3Q92570 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR4A3Q92570 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR4A3Q92570 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR4A3Q92570 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR4A3Q92570 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR4A3Q92570 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR4A3Q92570 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR4A3Q92570 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR4A3Q92570 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR4A3Q92570 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR4A3Q92570 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR4A3Q92570 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR4A3Q92570 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms