Protein–RNA interactions for Protein: Q92543

SNX19, Sorting nexin-19, humanhuman

Predictions only

Length 992 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX19Q92543 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX19Q92543 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX19Q92543 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX19Q92543 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX19Q92543 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX19Q92543 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX19Q92543 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX19Q92543 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX19Q92543 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX19Q92543 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX19Q92543 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX19Q92543 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX19Q92543 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX19Q92543 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX19Q92543 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX19Q92543 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX19Q92543 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX19Q92543 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX19Q92543 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX19Q92543 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX19Q92543 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX19Q92543 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX19Q92543 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX19Q92543 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX19Q92543 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX19Q92543 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX19Q92543 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX19Q92543 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX19Q92543 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX19Q92543 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX19Q92543 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX19Q92543 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX19Q92543 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX19Q92543 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX19Q92543 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX19Q92543 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX19Q92543 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX19Q92543 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX19Q92543 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX19Q92543 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX19Q92543 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX19Q92543 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX19Q92543 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX19Q92543 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX19Q92543 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX19Q92543 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX19Q92543 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX19Q92543 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX19Q92543 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX19Q92543 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX19Q92543 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX19Q92543 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX19Q92543 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX19Q92543 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX19Q92543 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX19Q92543 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX19Q92543 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX19Q92543 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX19Q92543 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX19Q92543 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX19Q92543 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX19Q92543 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX19Q92543 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX19Q92543 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX19Q92543 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX19Q92543 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX19Q92543 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX19Q92543 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX19Q92543 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX19Q92543 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX19Q92543 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX19Q92543 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX19Q92543 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX19Q92543 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX19Q92543 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX19Q92543 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX19Q92543 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX19Q92543 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX19Q92543 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX19Q92543 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX19Q92543 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX19Q92543 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX19Q92543 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX19Q92543 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX19Q92543 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX19Q92543 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX19Q92543 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX19Q92543 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX19Q92543 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX19Q92543 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX19Q92543 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX19Q92543 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX19Q92543 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX19Q92543 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX19Q92543 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX19Q92543 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX19Q92543 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX19Q92543 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX19Q92543 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX19Q92543 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms