Protein–RNA interactions for Protein: Q92529

SHC3, SHC-transforming protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC3Q92529 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHC3Q92529 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHC3Q92529 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHC3Q92529 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHC3Q92529 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHC3Q92529 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHC3Q92529 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHC3Q92529 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHC3Q92529 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHC3Q92529 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHC3Q92529 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SHC3Q92529 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHC3Q92529 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHC3Q92529 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHC3Q92529 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SHC3Q92529 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SHC3Q92529 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHC3Q92529 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHC3Q92529 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHC3Q92529 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHC3Q92529 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHC3Q92529 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHC3Q92529 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHC3Q92529 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHC3Q92529 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHC3Q92529 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHC3Q92529 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHC3Q92529 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHC3Q92529 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SHC3Q92529 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHC3Q92529 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHC3Q92529 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SHC3Q92529 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHC3Q92529 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHC3Q92529 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHC3Q92529 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHC3Q92529 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHC3Q92529 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHC3Q92529 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHC3Q92529 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHC3Q92529 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHC3Q92529 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHC3Q92529 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHC3Q92529 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHC3Q92529 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHC3Q92529 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHC3Q92529 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHC3Q92529 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SHC3Q92529 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHC3Q92529 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHC3Q92529 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHC3Q92529 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHC3Q92529 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHC3Q92529 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHC3Q92529 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHC3Q92529 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHC3Q92529 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHC3Q92529 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHC3Q92529 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHC3Q92529 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHC3Q92529 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHC3Q92529 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHC3Q92529 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHC3Q92529 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHC3Q92529 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHC3Q92529 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHC3Q92529 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHC3Q92529 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHC3Q92529 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHC3Q92529 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHC3Q92529 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHC3Q92529 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SHC3Q92529 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHC3Q92529 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHC3Q92529 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHC3Q92529 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHC3Q92529 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHC3Q92529 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHC3Q92529 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SHC3Q92529 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHC3Q92529 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHC3Q92529 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHC3Q92529 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHC3Q92529 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
SHC3Q92529 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SHC3Q92529 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHC3Q92529 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHC3Q92529 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHC3Q92529 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHC3Q92529 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHC3Q92529 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHC3Q92529 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHC3Q92529 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHC3Q92529 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHC3Q92529 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHC3Q92529 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHC3Q92529 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SHC3Q92529 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHC3Q92529 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHC3Q92529 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.2 ms