Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF7

ATL1, Atlastin-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL1Q8WXF7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATL1Q8WXF7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATL1Q8WXF7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATL1Q8WXF7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATL1Q8WXF7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATL1Q8WXF7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATL1Q8WXF7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATL1Q8WXF7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATL1Q8WXF7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATL1Q8WXF7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATL1Q8WXF7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATL1Q8WXF7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATL1Q8WXF7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATL1Q8WXF7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATL1Q8WXF7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATL1Q8WXF7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATL1Q8WXF7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATL1Q8WXF7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATL1Q8WXF7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATL1Q8WXF7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATL1Q8WXF7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATL1Q8WXF7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATL1Q8WXF7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATL1Q8WXF7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATL1Q8WXF7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATL1Q8WXF7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATL1Q8WXF7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATL1Q8WXF7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATL1Q8WXF7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATL1Q8WXF7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATL1Q8WXF7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATL1Q8WXF7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATL1Q8WXF7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATL1Q8WXF7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATL1Q8WXF7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATL1Q8WXF7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATL1Q8WXF7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATL1Q8WXF7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATL1Q8WXF7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATL1Q8WXF7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATL1Q8WXF7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATL1Q8WXF7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATL1Q8WXF7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATL1Q8WXF7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATL1Q8WXF7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATL1Q8WXF7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATL1Q8WXF7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATL1Q8WXF7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATL1Q8WXF7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATL1Q8WXF7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATL1Q8WXF7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATL1Q8WXF7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATL1Q8WXF7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATL1Q8WXF7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATL1Q8WXF7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATL1Q8WXF7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATL1Q8WXF7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATL1Q8WXF7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATL1Q8WXF7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATL1Q8WXF7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATL1Q8WXF7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATL1Q8WXF7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATL1Q8WXF7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ATL1Q8WXF7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATL1Q8WXF7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATL1Q8WXF7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATL1Q8WXF7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATL1Q8WXF7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATL1Q8WXF7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATL1Q8WXF7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATL1Q8WXF7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATL1Q8WXF7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATL1Q8WXF7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATL1Q8WXF7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATL1Q8WXF7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATL1Q8WXF7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATL1Q8WXF7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATL1Q8WXF7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATL1Q8WXF7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATL1Q8WXF7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATL1Q8WXF7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATL1Q8WXF7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATL1Q8WXF7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATL1Q8WXF7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATL1Q8WXF7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATL1Q8WXF7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATL1Q8WXF7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATL1Q8WXF7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATL1Q8WXF7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATL1Q8WXF7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATL1Q8WXF7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATL1Q8WXF7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATL1Q8WXF7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATL1Q8WXF7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATL1Q8WXF7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATL1Q8WXF7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATL1Q8WXF7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATL1Q8WXF7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATL1Q8WXF7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATL1Q8WXF7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms