Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV22

NSMCE1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE1Q8WV22 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSMCE1Q8WV22 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSMCE1Q8WV22 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSMCE1Q8WV22 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSMCE1Q8WV22 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSMCE1Q8WV22 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSMCE1Q8WV22 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NSMCE1Q8WV22 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSMCE1Q8WV22 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSMCE1Q8WV22 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSMCE1Q8WV22 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSMCE1Q8WV22 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSMCE1Q8WV22 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSMCE1Q8WV22 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSMCE1Q8WV22 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NSMCE1Q8WV22 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NSMCE1Q8WV22 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSMCE1Q8WV22 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSMCE1Q8WV22 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSMCE1Q8WV22 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSMCE1Q8WV22 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSMCE1Q8WV22 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSMCE1Q8WV22 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSMCE1Q8WV22 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSMCE1Q8WV22 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NSMCE1Q8WV22 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NSMCE1Q8WV22 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NSMCE1Q8WV22 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NSMCE1Q8WV22 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NSMCE1Q8WV22 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSMCE1Q8WV22 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSMCE1Q8WV22 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSMCE1Q8WV22 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSMCE1Q8WV22 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSMCE1Q8WV22 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NSMCE1Q8WV22 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSMCE1Q8WV22 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NSMCE1Q8WV22 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSMCE1Q8WV22 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSMCE1Q8WV22 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSMCE1Q8WV22 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSMCE1Q8WV22 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSMCE1Q8WV22 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSMCE1Q8WV22 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSMCE1Q8WV22 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSMCE1Q8WV22 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSMCE1Q8WV22 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSMCE1Q8WV22 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSMCE1Q8WV22 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSMCE1Q8WV22 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSMCE1Q8WV22 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NSMCE1Q8WV22 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSMCE1Q8WV22 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSMCE1Q8WV22 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSMCE1Q8WV22 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSMCE1Q8WV22 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSMCE1Q8WV22 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NSMCE1Q8WV22 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSMCE1Q8WV22 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSMCE1Q8WV22 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSMCE1Q8WV22 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSMCE1Q8WV22 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSMCE1Q8WV22 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSMCE1Q8WV22 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSMCE1Q8WV22 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSMCE1Q8WV22 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NSMCE1Q8WV22 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSMCE1Q8WV22 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSMCE1Q8WV22 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSMCE1Q8WV22 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSMCE1Q8WV22 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSMCE1Q8WV22 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NSMCE1Q8WV22 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NSMCE1Q8WV22 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSMCE1Q8WV22 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSMCE1Q8WV22 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSMCE1Q8WV22 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSMCE1Q8WV22 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSMCE1Q8WV22 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSMCE1Q8WV22 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSMCE1Q8WV22 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSMCE1Q8WV22 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSMCE1Q8WV22 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSMCE1Q8WV22 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSMCE1Q8WV22 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSMCE1Q8WV22 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSMCE1Q8WV22 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSMCE1Q8WV22 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSMCE1Q8WV22 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSMCE1Q8WV22 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSMCE1Q8WV22 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSMCE1Q8WV22 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSMCE1Q8WV22 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSMCE1Q8WV22 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSMCE1Q8WV22 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSMCE1Q8WV22 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSMCE1Q8WV22 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSMCE1Q8WV22 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSMCE1Q8WV22 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSMCE1Q8WV22 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms