Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF40

FNIP1, Folliculin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNIP1Q8TF40 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FNIP1Q8TF40 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FNIP1Q8TF40 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FNIP1Q8TF40 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FNIP1Q8TF40 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FNIP1Q8TF40 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FNIP1Q8TF40 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FNIP1Q8TF40 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FNIP1Q8TF40 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FNIP1Q8TF40 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FNIP1Q8TF40 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
FNIP1Q8TF40 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FNIP1Q8TF40 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FNIP1Q8TF40 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FNIP1Q8TF40 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FNIP1Q8TF40 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FNIP1Q8TF40 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FNIP1Q8TF40 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FNIP1Q8TF40 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FNIP1Q8TF40 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FNIP1Q8TF40 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FNIP1Q8TF40 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FNIP1Q8TF40 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FNIP1Q8TF40 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FNIP1Q8TF40 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FNIP1Q8TF40 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FNIP1Q8TF40 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FNIP1Q8TF40 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FNIP1Q8TF40 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FNIP1Q8TF40 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FNIP1Q8TF40 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FNIP1Q8TF40 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FNIP1Q8TF40 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FNIP1Q8TF40 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FNIP1Q8TF40 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FNIP1Q8TF40 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FNIP1Q8TF40 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FNIP1Q8TF40 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FNIP1Q8TF40 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FNIP1Q8TF40 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FNIP1Q8TF40 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FNIP1Q8TF40 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FNIP1Q8TF40 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FNIP1Q8TF40 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FNIP1Q8TF40 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FNIP1Q8TF40 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FNIP1Q8TF40 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FNIP1Q8TF40 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FNIP1Q8TF40 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FNIP1Q8TF40 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FNIP1Q8TF40 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FNIP1Q8TF40 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FNIP1Q8TF40 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FNIP1Q8TF40 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FNIP1Q8TF40 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FNIP1Q8TF40 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FNIP1Q8TF40 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FNIP1Q8TF40 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FNIP1Q8TF40 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FNIP1Q8TF40 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FNIP1Q8TF40 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FNIP1Q8TF40 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FNIP1Q8TF40 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FNIP1Q8TF40 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FNIP1Q8TF40 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FNIP1Q8TF40 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FNIP1Q8TF40 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FNIP1Q8TF40 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FNIP1Q8TF40 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FNIP1Q8TF40 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FNIP1Q8TF40 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FNIP1Q8TF40 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FNIP1Q8TF40 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FNIP1Q8TF40 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FNIP1Q8TF40 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FNIP1Q8TF40 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FNIP1Q8TF40 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FNIP1Q8TF40 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FNIP1Q8TF40 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FNIP1Q8TF40 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FNIP1Q8TF40 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FNIP1Q8TF40 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FNIP1Q8TF40 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FNIP1Q8TF40 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FNIP1Q8TF40 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FNIP1Q8TF40 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FNIP1Q8TF40 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FNIP1Q8TF40 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FNIP1Q8TF40 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FNIP1Q8TF40 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FNIP1Q8TF40 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FNIP1Q8TF40 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FNIP1Q8TF40 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FNIP1Q8TF40 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FNIP1Q8TF40 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FNIP1Q8TF40 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FNIP1Q8TF40 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FNIP1Q8TF40 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FNIP1Q8TF40 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FNIP1Q8TF40 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.2 ms