Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEL6

TRPC4AP, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4APQ8TEL6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPC4APQ8TEL6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPC4APQ8TEL6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRPC4APQ8TEL6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPC4APQ8TEL6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPC4APQ8TEL6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPC4APQ8TEL6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPC4APQ8TEL6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPC4APQ8TEL6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPC4APQ8TEL6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPC4APQ8TEL6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRPC4APQ8TEL6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRPC4APQ8TEL6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRPC4APQ8TEL6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRPC4APQ8TEL6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRPC4APQ8TEL6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC4APQ8TEL6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC4APQ8TEL6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC4APQ8TEL6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC4APQ8TEL6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC4APQ8TEL6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC4APQ8TEL6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC4APQ8TEL6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC4APQ8TEL6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRPC4APQ8TEL6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPC4APQ8TEL6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPC4APQ8TEL6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPC4APQ8TEL6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPC4APQ8TEL6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPC4APQ8TEL6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPC4APQ8TEL6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPC4APQ8TEL6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPC4APQ8TEL6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPC4APQ8TEL6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPC4APQ8TEL6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPC4APQ8TEL6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPC4APQ8TEL6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPC4APQ8TEL6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPC4APQ8TEL6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPC4APQ8TEL6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPC4APQ8TEL6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
TRPC4APQ8TEL6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRPC4APQ8TEL6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms