Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEC5

SH3RF2, Putative E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF2, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF2Q8TEC5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3RF2Q8TEC5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3RF2Q8TEC5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3RF2Q8TEC5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3RF2Q8TEC5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3RF2Q8TEC5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3RF2Q8TEC5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3RF2Q8TEC5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3RF2Q8TEC5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3RF2Q8TEC5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3RF2Q8TEC5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3RF2Q8TEC5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3RF2Q8TEC5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3RF2Q8TEC5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3RF2Q8TEC5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3RF2Q8TEC5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3RF2Q8TEC5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3RF2Q8TEC5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3RF2Q8TEC5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SH3RF2Q8TEC5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3RF2Q8TEC5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3RF2Q8TEC5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3RF2Q8TEC5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3RF2Q8TEC5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3RF2Q8TEC5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3RF2Q8TEC5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3RF2Q8TEC5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3RF2Q8TEC5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3RF2Q8TEC5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3RF2Q8TEC5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3RF2Q8TEC5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3RF2Q8TEC5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3RF2Q8TEC5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3RF2Q8TEC5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3RF2Q8TEC5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3RF2Q8TEC5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3RF2Q8TEC5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3RF2Q8TEC5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3RF2Q8TEC5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3RF2Q8TEC5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3RF2Q8TEC5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3RF2Q8TEC5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3RF2Q8TEC5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3RF2Q8TEC5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3RF2Q8TEC5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3RF2Q8TEC5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3RF2Q8TEC5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3RF2Q8TEC5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3RF2Q8TEC5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3RF2Q8TEC5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3RF2Q8TEC5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3RF2Q8TEC5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3RF2Q8TEC5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3RF2Q8TEC5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3RF2Q8TEC5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3RF2Q8TEC5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SH3RF2Q8TEC5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SH3RF2Q8TEC5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SH3RF2Q8TEC5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SH3RF2Q8TEC5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3RF2Q8TEC5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3RF2Q8TEC5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3RF2Q8TEC5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3RF2Q8TEC5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3RF2Q8TEC5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3RF2Q8TEC5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3RF2Q8TEC5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3RF2Q8TEC5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3RF2Q8TEC5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3RF2Q8TEC5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3RF2Q8TEC5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3RF2Q8TEC5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3RF2Q8TEC5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3RF2Q8TEC5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH3RF2Q8TEC5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH3RF2Q8TEC5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH3RF2Q8TEC5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH3RF2Q8TEC5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH3RF2Q8TEC5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH3RF2Q8TEC5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH3RF2Q8TEC5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH3RF2Q8TEC5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH3RF2Q8TEC5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3RF2Q8TEC5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3RF2Q8TEC5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3RF2Q8TEC5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3RF2Q8TEC5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3RF2Q8TEC5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3RF2Q8TEC5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3RF2Q8TEC5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3RF2Q8TEC5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3RF2Q8TEC5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3RF2Q8TEC5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3RF2Q8TEC5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3RF2Q8TEC5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3RF2Q8TEC5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3RF2Q8TEC5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3RF2Q8TEC5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3RF2Q8TEC5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3RF2Q8TEC5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms