Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY8

IGDCC4, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC4Q8TDY8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IGDCC4Q8TDY8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IGDCC4Q8TDY8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
IGDCC4Q8TDY8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IGDCC4Q8TDY8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IGDCC4Q8TDY8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
IGDCC4Q8TDY8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IGDCC4Q8TDY8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IGDCC4Q8TDY8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IGDCC4Q8TDY8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IGDCC4Q8TDY8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IGDCC4Q8TDY8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IGDCC4Q8TDY8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IGDCC4Q8TDY8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IGDCC4Q8TDY8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IGDCC4Q8TDY8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IGDCC4Q8TDY8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IGDCC4Q8TDY8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IGDCC4Q8TDY8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IGDCC4Q8TDY8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IGDCC4Q8TDY8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IGDCC4Q8TDY8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IGDCC4Q8TDY8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
IGDCC4Q8TDY8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IGDCC4Q8TDY8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IGDCC4Q8TDY8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
IGDCC4Q8TDY8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
IGDCC4Q8TDY8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IGDCC4Q8TDY8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IGDCC4Q8TDY8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IGDCC4Q8TDY8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IGDCC4Q8TDY8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IGDCC4Q8TDY8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IGDCC4Q8TDY8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IGDCC4Q8TDY8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IGDCC4Q8TDY8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
IGDCC4Q8TDY8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IGDCC4Q8TDY8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IGDCC4Q8TDY8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
IGDCC4Q8TDY8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IGDCC4Q8TDY8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IGDCC4Q8TDY8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IGDCC4Q8TDY8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IGDCC4Q8TDY8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IGDCC4Q8TDY8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IGDCC4Q8TDY8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IGDCC4Q8TDY8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
IGDCC4Q8TDY8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
IGDCC4Q8TDY8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IGDCC4Q8TDY8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IGDCC4Q8TDY8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IGDCC4Q8TDY8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IGDCC4Q8TDY8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IGDCC4Q8TDY8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IGDCC4Q8TDY8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IGDCC4Q8TDY8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
IGDCC4Q8TDY8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IGDCC4Q8TDY8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IGDCC4Q8TDY8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IGDCC4Q8TDY8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IGDCC4Q8TDY8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IGDCC4Q8TDY8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IGDCC4Q8TDY8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IGDCC4Q8TDY8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IGDCC4Q8TDY8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IGDCC4Q8TDY8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IGDCC4Q8TDY8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IGDCC4Q8TDY8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IGDCC4Q8TDY8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IGDCC4Q8TDY8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IGDCC4Q8TDY8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IGDCC4Q8TDY8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IGDCC4Q8TDY8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IGDCC4Q8TDY8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IGDCC4Q8TDY8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IGDCC4Q8TDY8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
IGDCC4Q8TDY8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
IGDCC4Q8TDY8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IGDCC4Q8TDY8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
IGDCC4Q8TDY8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IGDCC4Q8TDY8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IGDCC4Q8TDY8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IGDCC4Q8TDY8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IGDCC4Q8TDY8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IGDCC4Q8TDY8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IGDCC4Q8TDY8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IGDCC4Q8TDY8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IGDCC4Q8TDY8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
IGDCC4Q8TDY8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IGDCC4Q8TDY8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IGDCC4Q8TDY8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IGDCC4Q8TDY8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IGDCC4Q8TDY8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IGDCC4Q8TDY8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
IGDCC4Q8TDY8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IGDCC4Q8TDY8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IGDCC4Q8TDY8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IGDCC4Q8TDY8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IGDCC4Q8TDY8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IGDCC4Q8TDY8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms