Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE1

CNIH3, Protein cornichon homolog 3, humanhuman

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3Q8TBE1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNIH3Q8TBE1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNIH3Q8TBE1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNIH3Q8TBE1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNIH3Q8TBE1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNIH3Q8TBE1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CNIH3Q8TBE1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNIH3Q8TBE1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNIH3Q8TBE1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNIH3Q8TBE1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNIH3Q8TBE1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNIH3Q8TBE1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNIH3Q8TBE1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNIH3Q8TBE1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNIH3Q8TBE1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNIH3Q8TBE1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNIH3Q8TBE1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNIH3Q8TBE1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNIH3Q8TBE1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNIH3Q8TBE1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNIH3Q8TBE1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNIH3Q8TBE1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNIH3Q8TBE1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNIH3Q8TBE1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNIH3Q8TBE1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNIH3Q8TBE1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNIH3Q8TBE1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNIH3Q8TBE1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNIH3Q8TBE1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNIH3Q8TBE1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNIH3Q8TBE1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNIH3Q8TBE1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNIH3Q8TBE1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNIH3Q8TBE1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNIH3Q8TBE1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNIH3Q8TBE1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNIH3Q8TBE1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNIH3Q8TBE1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNIH3Q8TBE1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNIH3Q8TBE1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNIH3Q8TBE1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CNIH3Q8TBE1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNIH3Q8TBE1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CNIH3Q8TBE1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CNIH3Q8TBE1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNIH3Q8TBE1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
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