Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG06

TRIM58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM58Q8NG06 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM58Q8NG06 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM58Q8NG06 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM58Q8NG06 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM58Q8NG06 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM58Q8NG06 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM58Q8NG06 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM58Q8NG06 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM58Q8NG06 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM58Q8NG06 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM58Q8NG06 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM58Q8NG06 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM58Q8NG06 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM58Q8NG06 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM58Q8NG06 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM58Q8NG06 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM58Q8NG06 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM58Q8NG06 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM58Q8NG06 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM58Q8NG06 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM58Q8NG06 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM58Q8NG06 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM58Q8NG06 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM58Q8NG06 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM58Q8NG06 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM58Q8NG06 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM58Q8NG06 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM58Q8NG06 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM58Q8NG06 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM58Q8NG06 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM58Q8NG06 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM58Q8NG06 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM58Q8NG06 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM58Q8NG06 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM58Q8NG06 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM58Q8NG06 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM58Q8NG06 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM58Q8NG06 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM58Q8NG06 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM58Q8NG06 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM58Q8NG06 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM58Q8NG06 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM58Q8NG06 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM58Q8NG06 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM58Q8NG06 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM58Q8NG06 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM58Q8NG06 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM58Q8NG06 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM58Q8NG06 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM58Q8NG06 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM58Q8NG06 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM58Q8NG06 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM58Q8NG06 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM58Q8NG06 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM58Q8NG06 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM58Q8NG06 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM58Q8NG06 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM58Q8NG06 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM58Q8NG06 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM58Q8NG06 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM58Q8NG06 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM58Q8NG06 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM58Q8NG06 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM58Q8NG06 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM58Q8NG06 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM58Q8NG06 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM58Q8NG06 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM58Q8NG06 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM58Q8NG06 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM58Q8NG06 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM58Q8NG06 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM58Q8NG06 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM58Q8NG06 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM58Q8NG06 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM58Q8NG06 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM58Q8NG06 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM58Q8NG06 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM58Q8NG06 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM58Q8NG06 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM58Q8NG06 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM58Q8NG06 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM58Q8NG06 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM58Q8NG06 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM58Q8NG06 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM58Q8NG06 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIM58Q8NG06 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM58Q8NG06 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM58Q8NG06 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM58Q8NG06 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM58Q8NG06 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM58Q8NG06 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM58Q8NG06 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM58Q8NG06 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM58Q8NG06 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM58Q8NG06 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM58Q8NG06 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM58Q8NG06 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM58Q8NG06 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM58Q8NG06 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM58Q8NG06 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 249.2 ms