Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEY3

SPATA4, Spermatogenesis-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA4Q8NEY3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPATA4Q8NEY3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPATA4Q8NEY3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPATA4Q8NEY3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPATA4Q8NEY3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPATA4Q8NEY3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPATA4Q8NEY3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPATA4Q8NEY3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SPATA4Q8NEY3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SPATA4Q8NEY3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPATA4Q8NEY3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPATA4Q8NEY3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPATA4Q8NEY3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPATA4Q8NEY3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SPATA4Q8NEY3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPATA4Q8NEY3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPATA4Q8NEY3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPATA4Q8NEY3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPATA4Q8NEY3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPATA4Q8NEY3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPATA4Q8NEY3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPATA4Q8NEY3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPATA4Q8NEY3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPATA4Q8NEY3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPATA4Q8NEY3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPATA4Q8NEY3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPATA4Q8NEY3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPATA4Q8NEY3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPATA4Q8NEY3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPATA4Q8NEY3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPATA4Q8NEY3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPATA4Q8NEY3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPATA4Q8NEY3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPATA4Q8NEY3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPATA4Q8NEY3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPATA4Q8NEY3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPATA4Q8NEY3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPATA4Q8NEY3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPATA4Q8NEY3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SPATA4Q8NEY3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPATA4Q8NEY3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPATA4Q8NEY3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPATA4Q8NEY3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPATA4Q8NEY3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPATA4Q8NEY3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPATA4Q8NEY3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPATA4Q8NEY3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPATA4Q8NEY3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPATA4Q8NEY3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPATA4Q8NEY3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPATA4Q8NEY3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPATA4Q8NEY3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPATA4Q8NEY3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPATA4Q8NEY3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SPATA4Q8NEY3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPATA4Q8NEY3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPATA4Q8NEY3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPATA4Q8NEY3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPATA4Q8NEY3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPATA4Q8NEY3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SPATA4Q8NEY3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPATA4Q8NEY3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPATA4Q8NEY3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPATA4Q8NEY3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPATA4Q8NEY3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPATA4Q8NEY3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPATA4Q8NEY3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPATA4Q8NEY3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPATA4Q8NEY3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SPATA4Q8NEY3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPATA4Q8NEY3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPATA4Q8NEY3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPATA4Q8NEY3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPATA4Q8NEY3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPATA4Q8NEY3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPATA4Q8NEY3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPATA4Q8NEY3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPATA4Q8NEY3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPATA4Q8NEY3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPATA4Q8NEY3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPATA4Q8NEY3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPATA4Q8NEY3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPATA4Q8NEY3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPATA4Q8NEY3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPATA4Q8NEY3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPATA4Q8NEY3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPATA4Q8NEY3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPATA4Q8NEY3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPATA4Q8NEY3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPATA4Q8NEY3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPATA4Q8NEY3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPATA4Q8NEY3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPATA4Q8NEY3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPATA4Q8NEY3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPATA4Q8NEY3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPATA4Q8NEY3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPATA4Q8NEY3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPATA4Q8NEY3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPATA4Q8NEY3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPATA4Q8NEY3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms