Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APCDD1LQ8NCL9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APCDD1LQ8NCL9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
APCDD1LQ8NCL9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APCDD1LQ8NCL9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APCDD1LQ8NCL9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APCDD1LQ8NCL9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APCDD1LQ8NCL9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APCDD1LQ8NCL9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APCDD1LQ8NCL9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APCDD1LQ8NCL9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
APCDD1LQ8NCL9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APCDD1LQ8NCL9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APCDD1LQ8NCL9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APCDD1LQ8NCL9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APCDD1LQ8NCL9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APCDD1LQ8NCL9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APCDD1LQ8NCL9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
APCDD1LQ8NCL9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APCDD1LQ8NCL9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APCDD1LQ8NCL9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APCDD1LQ8NCL9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APCDD1LQ8NCL9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APCDD1LQ8NCL9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
APCDD1LQ8NCL9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APCDD1LQ8NCL9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APCDD1LQ8NCL9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APCDD1LQ8NCL9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APCDD1LQ8NCL9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APCDD1LQ8NCL9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APCDD1LQ8NCL9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APCDD1LQ8NCL9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APCDD1LQ8NCL9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APCDD1LQ8NCL9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APCDD1LQ8NCL9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APCDD1LQ8NCL9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APCDD1LQ8NCL9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APCDD1LQ8NCL9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APCDD1LQ8NCL9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APCDD1LQ8NCL9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APCDD1LQ8NCL9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APCDD1LQ8NCL9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APCDD1LQ8NCL9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APCDD1LQ8NCL9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APCDD1LQ8NCL9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APCDD1LQ8NCL9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APCDD1LQ8NCL9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APCDD1LQ8NCL9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APCDD1LQ8NCL9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APCDD1LQ8NCL9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APCDD1LQ8NCL9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APCDD1LQ8NCL9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
APCDD1LQ8NCL9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APCDD1LQ8NCL9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APCDD1LQ8NCL9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APCDD1LQ8NCL9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APCDD1LQ8NCL9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APCDD1LQ8NCL9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APCDD1LQ8NCL9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APCDD1LQ8NCL9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APCDD1LQ8NCL9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APCDD1LQ8NCL9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APCDD1LQ8NCL9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APCDD1LQ8NCL9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APCDD1LQ8NCL9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APCDD1LQ8NCL9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APCDD1LQ8NCL9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APCDD1LQ8NCL9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APCDD1LQ8NCL9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APCDD1LQ8NCL9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APCDD1LQ8NCL9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APCDD1LQ8NCL9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
APCDD1LQ8NCL9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APCDD1LQ8NCL9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APCDD1LQ8NCL9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APCDD1LQ8NCL9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APCDD1LQ8NCL9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APCDD1LQ8NCL9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APCDD1LQ8NCL9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APCDD1LQ8NCL9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APCDD1LQ8NCL9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APCDD1LQ8NCL9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APCDD1LQ8NCL9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APCDD1LQ8NCL9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APCDD1LQ8NCL9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APCDD1LQ8NCL9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APCDD1LQ8NCL9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APCDD1LQ8NCL9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APCDD1LQ8NCL9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APCDD1LQ8NCL9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
APCDD1LQ8NCL9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APCDD1LQ8NCL9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APCDD1LQ8NCL9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms