Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
AVL9Q8NBF6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AVL9Q8NBF6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AVL9Q8NBF6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AVL9Q8NBF6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AVL9Q8NBF6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
AVL9Q8NBF6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AVL9Q8NBF6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AVL9Q8NBF6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AVL9Q8NBF6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AVL9Q8NBF6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AVL9Q8NBF6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AVL9Q8NBF6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AVL9Q8NBF6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AVL9Q8NBF6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AVL9Q8NBF6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AVL9Q8NBF6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AVL9Q8NBF6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AVL9Q8NBF6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AVL9Q8NBF6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AVL9Q8NBF6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AVL9Q8NBF6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AVL9Q8NBF6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AVL9Q8NBF6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AVL9Q8NBF6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AVL9Q8NBF6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
AVL9Q8NBF6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AVL9Q8NBF6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AVL9Q8NBF6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AVL9Q8NBF6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AVL9Q8NBF6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AVL9Q8NBF6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AVL9Q8NBF6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AVL9Q8NBF6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AVL9Q8NBF6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AVL9Q8NBF6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AVL9Q8NBF6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AVL9Q8NBF6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AVL9Q8NBF6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
AVL9Q8NBF6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AVL9Q8NBF6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AVL9Q8NBF6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AVL9Q8NBF6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AVL9Q8NBF6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AVL9Q8NBF6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AVL9Q8NBF6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AVL9Q8NBF6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AVL9Q8NBF6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AVL9Q8NBF6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AVL9Q8NBF6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
AVL9Q8NBF6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
AVL9Q8NBF6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AVL9Q8NBF6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AVL9Q8NBF6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AVL9Q8NBF6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AVL9Q8NBF6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AVL9Q8NBF6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AVL9Q8NBF6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AVL9Q8NBF6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AVL9Q8NBF6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AVL9Q8NBF6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AVL9Q8NBF6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AVL9Q8NBF6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AVL9Q8NBF6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AVL9Q8NBF6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AVL9Q8NBF6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AVL9Q8NBF6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AVL9Q8NBF6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AVL9Q8NBF6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AVL9Q8NBF6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AVL9Q8NBF6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AVL9Q8NBF6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AVL9Q8NBF6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AVL9Q8NBF6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AVL9Q8NBF6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
AVL9Q8NBF6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AVL9Q8NBF6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AVL9Q8NBF6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AVL9Q8NBF6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AVL9Q8NBF6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AVL9Q8NBF6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AVL9Q8NBF6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AVL9Q8NBF6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AVL9Q8NBF6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AVL9Q8NBF6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AVL9Q8NBF6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
AVL9Q8NBF6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AVL9Q8NBF6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AVL9Q8NBF6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AVL9Q8NBF6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AVL9Q8NBF6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
AVL9Q8NBF6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AVL9Q8NBF6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AVL9Q8NBF6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AVL9Q8NBF6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AVL9Q8NBF6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AVL9Q8NBF6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AVL9Q8NBF6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AVL9Q8NBF6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AVL9Q8NBF6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms