Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC89Q8N998 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC89Q8N998 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC89Q8N998 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC89Q8N998 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC89Q8N998 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC89Q8N998 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC89Q8N998 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC89Q8N998 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC89Q8N998 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC89Q8N998 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC89Q8N998 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC89Q8N998 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC89Q8N998 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC89Q8N998 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC89Q8N998 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC89Q8N998 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC89Q8N998 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC89Q8N998 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC89Q8N998 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC89Q8N998 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC89Q8N998 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC89Q8N998 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC89Q8N998 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC89Q8N998 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC89Q8N998 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC89Q8N998 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC89Q8N998 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC89Q8N998 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC89Q8N998 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC89Q8N998 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC89Q8N998 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC89Q8N998 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC89Q8N998 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC89Q8N998 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC89Q8N998 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC89Q8N998 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC89Q8N998 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC89Q8N998 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC89Q8N998 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC89Q8N998 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC89Q8N998 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC89Q8N998 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC89Q8N998 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC89Q8N998 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC89Q8N998 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC89Q8N998 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC89Q8N998 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC89Q8N998 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC89Q8N998 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC89Q8N998 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC89Q8N998 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC89Q8N998 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC89Q8N998 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC89Q8N998 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC89Q8N998 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC89Q8N998 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC89Q8N998 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC89Q8N998 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC89Q8N998 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC89Q8N998 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC89Q8N998 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC89Q8N998 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC89Q8N998 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC89Q8N998 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC89Q8N998 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC89Q8N998 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC89Q8N998 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC89Q8N998 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC89Q8N998 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC89Q8N998 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC89Q8N998 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC89Q8N998 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC89Q8N998 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC89Q8N998 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC89Q8N998 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC89Q8N998 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC89Q8N998 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC89Q8N998 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC89Q8N998 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC89Q8N998 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC89Q8N998 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC89Q8N998 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC89Q8N998 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC89Q8N998 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC89Q8N998 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC89Q8N998 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC89Q8N998 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC89Q8N998 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC89Q8N998 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC89Q8N998 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC89Q8N998 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC89Q8N998 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC89Q8N998 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC89Q8N998 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC89Q8N998 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC89Q8N998 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC89Q8N998 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC89Q8N998 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC89Q8N998 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms