Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5U6

RNF10, RING finger protein 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF10Q8N5U6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF10Q8N5U6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF10Q8N5U6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF10Q8N5U6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF10Q8N5U6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF10Q8N5U6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF10Q8N5U6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF10Q8N5U6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF10Q8N5U6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF10Q8N5U6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF10Q8N5U6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF10Q8N5U6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF10Q8N5U6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF10Q8N5U6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF10Q8N5U6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF10Q8N5U6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF10Q8N5U6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF10Q8N5U6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF10Q8N5U6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF10Q8N5U6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF10Q8N5U6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF10Q8N5U6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF10Q8N5U6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF10Q8N5U6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF10Q8N5U6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF10Q8N5U6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF10Q8N5U6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF10Q8N5U6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF10Q8N5U6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF10Q8N5U6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF10Q8N5U6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF10Q8N5U6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF10Q8N5U6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF10Q8N5U6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF10Q8N5U6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF10Q8N5U6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF10Q8N5U6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF10Q8N5U6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF10Q8N5U6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF10Q8N5U6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF10Q8N5U6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF10Q8N5U6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF10Q8N5U6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF10Q8N5U6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF10Q8N5U6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF10Q8N5U6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF10Q8N5U6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF10Q8N5U6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF10Q8N5U6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF10Q8N5U6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF10Q8N5U6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF10Q8N5U6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF10Q8N5U6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF10Q8N5U6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF10Q8N5U6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF10Q8N5U6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF10Q8N5U6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF10Q8N5U6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF10Q8N5U6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF10Q8N5U6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF10Q8N5U6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF10Q8N5U6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF10Q8N5U6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF10Q8N5U6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF10Q8N5U6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF10Q8N5U6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF10Q8N5U6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF10Q8N5U6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF10Q8N5U6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF10Q8N5U6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF10Q8N5U6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF10Q8N5U6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF10Q8N5U6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF10Q8N5U6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF10Q8N5U6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF10Q8N5U6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF10Q8N5U6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF10Q8N5U6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF10Q8N5U6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF10Q8N5U6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF10Q8N5U6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF10Q8N5U6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF10Q8N5U6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF10Q8N5U6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF10Q8N5U6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF10Q8N5U6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF10Q8N5U6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF10Q8N5U6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF10Q8N5U6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF10Q8N5U6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF10Q8N5U6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF10Q8N5U6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF10Q8N5U6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF10Q8N5U6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF10Q8N5U6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF10Q8N5U6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF10Q8N5U6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF10Q8N5U6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF10Q8N5U6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF10Q8N5U6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms