Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J5

PPM1K, Protein phosphatase 1K, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1KQ8N3J5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPM1KQ8N3J5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPM1KQ8N3J5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPM1KQ8N3J5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPM1KQ8N3J5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPM1KQ8N3J5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPM1KQ8N3J5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPM1KQ8N3J5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPM1KQ8N3J5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPM1KQ8N3J5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPM1KQ8N3J5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPM1KQ8N3J5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPM1KQ8N3J5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPM1KQ8N3J5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPM1KQ8N3J5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPM1KQ8N3J5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPM1KQ8N3J5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPM1KQ8N3J5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPM1KQ8N3J5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPM1KQ8N3J5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPM1KQ8N3J5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPM1KQ8N3J5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPM1KQ8N3J5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPM1KQ8N3J5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPM1KQ8N3J5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPM1KQ8N3J5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPM1KQ8N3J5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPM1KQ8N3J5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPM1KQ8N3J5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPM1KQ8N3J5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPM1KQ8N3J5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPM1KQ8N3J5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPM1KQ8N3J5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPM1KQ8N3J5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPM1KQ8N3J5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPM1KQ8N3J5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPM1KQ8N3J5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPM1KQ8N3J5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPM1KQ8N3J5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPM1KQ8N3J5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPM1KQ8N3J5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPM1KQ8N3J5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPM1KQ8N3J5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PPM1KQ8N3J5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPM1KQ8N3J5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPM1KQ8N3J5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPM1KQ8N3J5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPM1KQ8N3J5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPM1KQ8N3J5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPM1KQ8N3J5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPM1KQ8N3J5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPM1KQ8N3J5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPM1KQ8N3J5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPM1KQ8N3J5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPM1KQ8N3J5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPM1KQ8N3J5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPM1KQ8N3J5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPM1KQ8N3J5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPM1KQ8N3J5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPM1KQ8N3J5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPM1KQ8N3J5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PPM1KQ8N3J5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPM1KQ8N3J5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPM1KQ8N3J5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPM1KQ8N3J5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPM1KQ8N3J5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPM1KQ8N3J5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPM1KQ8N3J5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPM1KQ8N3J5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPM1KQ8N3J5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPM1KQ8N3J5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPM1KQ8N3J5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPM1KQ8N3J5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPM1KQ8N3J5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPM1KQ8N3J5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPM1KQ8N3J5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPM1KQ8N3J5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PPM1KQ8N3J5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPM1KQ8N3J5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PPM1KQ8N3J5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPM1KQ8N3J5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPM1KQ8N3J5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPM1KQ8N3J5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPM1KQ8N3J5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPM1KQ8N3J5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPM1KQ8N3J5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPM1KQ8N3J5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPM1KQ8N3J5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPM1KQ8N3J5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPM1KQ8N3J5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPM1KQ8N3J5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPM1KQ8N3J5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PPM1KQ8N3J5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPM1KQ8N3J5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPM1KQ8N3J5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPM1KQ8N3J5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPM1KQ8N3J5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPM1KQ8N3J5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PPM1KQ8N3J5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPM1KQ8N3J5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms