Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2U9

PQLC1, PQ-loop repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PQLC1Q8N2U9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PQLC1Q8N2U9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PQLC1Q8N2U9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PQLC1Q8N2U9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PQLC1Q8N2U9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PQLC1Q8N2U9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PQLC1Q8N2U9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PQLC1Q8N2U9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PQLC1Q8N2U9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PQLC1Q8N2U9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PQLC1Q8N2U9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PQLC1Q8N2U9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PQLC1Q8N2U9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PQLC1Q8N2U9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PQLC1Q8N2U9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PQLC1Q8N2U9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PQLC1Q8N2U9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PQLC1Q8N2U9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PQLC1Q8N2U9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PQLC1Q8N2U9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PQLC1Q8N2U9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PQLC1Q8N2U9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PQLC1Q8N2U9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PQLC1Q8N2U9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PQLC1Q8N2U9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PQLC1Q8N2U9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PQLC1Q8N2U9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PQLC1Q8N2U9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PQLC1Q8N2U9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PQLC1Q8N2U9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PQLC1Q8N2U9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PQLC1Q8N2U9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PQLC1Q8N2U9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PQLC1Q8N2U9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PQLC1Q8N2U9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PQLC1Q8N2U9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PQLC1Q8N2U9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PQLC1Q8N2U9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PQLC1Q8N2U9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PQLC1Q8N2U9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PQLC1Q8N2U9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PQLC1Q8N2U9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PQLC1Q8N2U9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PQLC1Q8N2U9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PQLC1Q8N2U9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PQLC1Q8N2U9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PQLC1Q8N2U9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PQLC1Q8N2U9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PQLC1Q8N2U9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PQLC1Q8N2U9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PQLC1Q8N2U9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PQLC1Q8N2U9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PQLC1Q8N2U9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PQLC1Q8N2U9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PQLC1Q8N2U9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PQLC1Q8N2U9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PQLC1Q8N2U9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PQLC1Q8N2U9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PQLC1Q8N2U9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PQLC1Q8N2U9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PQLC1Q8N2U9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms