Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1L1

LINC00528, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00528, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00528Q8N1L1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00528Q8N1L1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms