Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYT3

CCDC170, Coiled-coil domain-containing protein 170, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC170Q8IYT3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC170Q8IYT3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC170Q8IYT3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC170Q8IYT3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC170Q8IYT3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC170Q8IYT3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC170Q8IYT3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC170Q8IYT3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC170Q8IYT3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC170Q8IYT3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC170Q8IYT3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC170Q8IYT3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC170Q8IYT3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC170Q8IYT3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC170Q8IYT3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC170Q8IYT3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC170Q8IYT3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC170Q8IYT3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC170Q8IYT3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC170Q8IYT3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC170Q8IYT3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC170Q8IYT3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC170Q8IYT3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC170Q8IYT3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC170Q8IYT3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC170Q8IYT3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC170Q8IYT3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC170Q8IYT3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC170Q8IYT3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC170Q8IYT3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC170Q8IYT3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC170Q8IYT3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC170Q8IYT3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC170Q8IYT3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC170Q8IYT3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC170Q8IYT3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC170Q8IYT3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC170Q8IYT3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC170Q8IYT3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC170Q8IYT3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC170Q8IYT3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC170Q8IYT3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC170Q8IYT3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC170Q8IYT3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC170Q8IYT3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC170Q8IYT3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC170Q8IYT3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC170Q8IYT3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC170Q8IYT3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC170Q8IYT3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC170Q8IYT3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC170Q8IYT3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC170Q8IYT3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC170Q8IYT3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC170Q8IYT3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC170Q8IYT3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC170Q8IYT3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC170Q8IYT3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC170Q8IYT3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC170Q8IYT3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC170Q8IYT3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC170Q8IYT3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC170Q8IYT3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC170Q8IYT3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC170Q8IYT3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC170Q8IYT3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC170Q8IYT3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC170Q8IYT3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC170Q8IYT3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC170Q8IYT3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC170Q8IYT3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC170Q8IYT3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC170Q8IYT3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC170Q8IYT3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC170Q8IYT3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC170Q8IYT3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC170Q8IYT3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC170Q8IYT3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC170Q8IYT3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC170Q8IYT3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC170Q8IYT3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC170Q8IYT3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC170Q8IYT3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC170Q8IYT3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC170Q8IYT3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC170Q8IYT3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC170Q8IYT3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC170Q8IYT3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC170Q8IYT3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
CCDC170Q8IYT3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC170Q8IYT3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC170Q8IYT3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC170Q8IYT3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC170Q8IYT3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC170Q8IYT3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC170Q8IYT3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC170Q8IYT3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC170Q8IYT3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC170Q8IYT3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC170Q8IYT3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms