Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVF7

FMNL3, Formin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMNL3Q8IVF7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FMNL3Q8IVF7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FMNL3Q8IVF7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FMNL3Q8IVF7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FMNL3Q8IVF7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FMNL3Q8IVF7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FMNL3Q8IVF7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FMNL3Q8IVF7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FMNL3Q8IVF7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FMNL3Q8IVF7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FMNL3Q8IVF7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FMNL3Q8IVF7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
FMNL3Q8IVF7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FMNL3Q8IVF7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FMNL3Q8IVF7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FMNL3Q8IVF7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FMNL3Q8IVF7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FMNL3Q8IVF7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FMNL3Q8IVF7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FMNL3Q8IVF7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FMNL3Q8IVF7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FMNL3Q8IVF7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FMNL3Q8IVF7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FMNL3Q8IVF7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FMNL3Q8IVF7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FMNL3Q8IVF7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FMNL3Q8IVF7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FMNL3Q8IVF7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FMNL3Q8IVF7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FMNL3Q8IVF7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FMNL3Q8IVF7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FMNL3Q8IVF7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FMNL3Q8IVF7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FMNL3Q8IVF7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FMNL3Q8IVF7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FMNL3Q8IVF7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FMNL3Q8IVF7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FMNL3Q8IVF7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FMNL3Q8IVF7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FMNL3Q8IVF7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FMNL3Q8IVF7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FMNL3Q8IVF7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FMNL3Q8IVF7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FMNL3Q8IVF7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FMNL3Q8IVF7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FMNL3Q8IVF7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FMNL3Q8IVF7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FMNL3Q8IVF7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FMNL3Q8IVF7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FMNL3Q8IVF7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
FMNL3Q8IVF7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FMNL3Q8IVF7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FMNL3Q8IVF7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FMNL3Q8IVF7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FMNL3Q8IVF7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FMNL3Q8IVF7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FMNL3Q8IVF7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FMNL3Q8IVF7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FMNL3Q8IVF7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FMNL3Q8IVF7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FMNL3Q8IVF7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FMNL3Q8IVF7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FMNL3Q8IVF7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FMNL3Q8IVF7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FMNL3Q8IVF7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FMNL3Q8IVF7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FMNL3Q8IVF7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FMNL3Q8IVF7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FMNL3Q8IVF7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FMNL3Q8IVF7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FMNL3Q8IVF7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FMNL3Q8IVF7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FMNL3Q8IVF7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FMNL3Q8IVF7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FMNL3Q8IVF7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FMNL3Q8IVF7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FMNL3Q8IVF7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FMNL3Q8IVF7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
FMNL3Q8IVF7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FMNL3Q8IVF7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FMNL3Q8IVF7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FMNL3Q8IVF7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FMNL3Q8IVF7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FMNL3Q8IVF7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
FMNL3Q8IVF7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FMNL3Q8IVF7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FMNL3Q8IVF7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
FMNL3Q8IVF7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
FMNL3Q8IVF7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FMNL3Q8IVF7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FMNL3Q8IVF7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FMNL3Q8IVF7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FMNL3Q8IVF7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FMNL3Q8IVF7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FMNL3Q8IVF7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FMNL3Q8IVF7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FMNL3Q8IVF7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FMNL3Q8IVF7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FMNL3Q8IVF7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FMNL3Q8IVF7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms