Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT2

VPS37D, Vacuolar protein sorting-associated protein 37D, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37DQ86XT2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
VPS37DQ86XT2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
VPS37DQ86XT2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
VPS37DQ86XT2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
VPS37DQ86XT2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
VPS37DQ86XT2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
VPS37DQ86XT2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
VPS37DQ86XT2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
VPS37DQ86XT2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
VPS37DQ86XT2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
VPS37DQ86XT2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
VPS37DQ86XT2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
VPS37DQ86XT2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
VPS37DQ86XT2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
VPS37DQ86XT2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
VPS37DQ86XT2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
VPS37DQ86XT2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
VPS37DQ86XT2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
VPS37DQ86XT2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
VPS37DQ86XT2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
VPS37DQ86XT2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
VPS37DQ86XT2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
VPS37DQ86XT2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
VPS37DQ86XT2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
VPS37DQ86XT2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
VPS37DQ86XT2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
VPS37DQ86XT2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
VPS37DQ86XT2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
VPS37DQ86XT2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
VPS37DQ86XT2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
VPS37DQ86XT2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
VPS37DQ86XT2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
VPS37DQ86XT2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
VPS37DQ86XT2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
VPS37DQ86XT2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
VPS37DQ86XT2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
VPS37DQ86XT2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
VPS37DQ86XT2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
VPS37DQ86XT2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
VPS37DQ86XT2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
VPS37DQ86XT2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
VPS37DQ86XT2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
VPS37DQ86XT2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
VPS37DQ86XT2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
VPS37DQ86XT2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
VPS37DQ86XT2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
VPS37DQ86XT2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
VPS37DQ86XT2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
VPS37DQ86XT2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
VPS37DQ86XT2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
VPS37DQ86XT2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
VPS37DQ86XT2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
VPS37DQ86XT2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
VPS37DQ86XT2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
VPS37DQ86XT2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
VPS37DQ86XT2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
VPS37DQ86XT2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
VPS37DQ86XT2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
VPS37DQ86XT2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
VPS37DQ86XT2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VPS37DQ86XT2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VPS37DQ86XT2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
VPS37DQ86XT2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
VPS37DQ86XT2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
VPS37DQ86XT2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VPS37DQ86XT2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
VPS37DQ86XT2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
VPS37DQ86XT2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VPS37DQ86XT2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VPS37DQ86XT2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VPS37DQ86XT2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VPS37DQ86XT2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VPS37DQ86XT2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VPS37DQ86XT2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VPS37DQ86XT2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VPS37DQ86XT2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
VPS37DQ86XT2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VPS37DQ86XT2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VPS37DQ86XT2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
VPS37DQ86XT2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
VPS37DQ86XT2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
VPS37DQ86XT2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VPS37DQ86XT2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VPS37DQ86XT2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
VPS37DQ86XT2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
VPS37DQ86XT2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
VPS37DQ86XT2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
VPS37DQ86XT2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
VPS37DQ86XT2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VPS37DQ86XT2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VPS37DQ86XT2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
VPS37DQ86XT2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
VPS37DQ86XT2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
VPS37DQ86XT2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VPS37DQ86XT2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VPS37DQ86XT2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
VPS37DQ86XT2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
VPS37DQ86XT2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VPS37DQ86XT2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
VPS37DQ86XT2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms