Protein–RNA interactions for Protein: Q86XE0

SNX32, Sorting nexin-32, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX32Q86XE0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX32Q86XE0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX32Q86XE0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX32Q86XE0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX32Q86XE0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX32Q86XE0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX32Q86XE0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX32Q86XE0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX32Q86XE0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX32Q86XE0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX32Q86XE0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX32Q86XE0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX32Q86XE0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX32Q86XE0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX32Q86XE0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX32Q86XE0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX32Q86XE0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX32Q86XE0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX32Q86XE0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX32Q86XE0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX32Q86XE0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX32Q86XE0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX32Q86XE0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX32Q86XE0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX32Q86XE0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX32Q86XE0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX32Q86XE0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX32Q86XE0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX32Q86XE0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX32Q86XE0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX32Q86XE0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX32Q86XE0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX32Q86XE0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX32Q86XE0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX32Q86XE0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX32Q86XE0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX32Q86XE0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX32Q86XE0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX32Q86XE0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX32Q86XE0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX32Q86XE0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX32Q86XE0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX32Q86XE0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX32Q86XE0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX32Q86XE0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX32Q86XE0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX32Q86XE0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX32Q86XE0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX32Q86XE0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX32Q86XE0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX32Q86XE0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX32Q86XE0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX32Q86XE0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX32Q86XE0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX32Q86XE0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX32Q86XE0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX32Q86XE0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX32Q86XE0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX32Q86XE0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX32Q86XE0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX32Q86XE0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX32Q86XE0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX32Q86XE0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX32Q86XE0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX32Q86XE0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX32Q86XE0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX32Q86XE0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX32Q86XE0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX32Q86XE0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX32Q86XE0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX32Q86XE0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX32Q86XE0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX32Q86XE0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX32Q86XE0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX32Q86XE0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX32Q86XE0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX32Q86XE0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX32Q86XE0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX32Q86XE0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX32Q86XE0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX32Q86XE0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX32Q86XE0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX32Q86XE0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX32Q86XE0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX32Q86XE0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX32Q86XE0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX32Q86XE0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX32Q86XE0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX32Q86XE0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX32Q86XE0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX32Q86XE0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX32Q86XE0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX32Q86XE0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX32Q86XE0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX32Q86XE0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX32Q86XE0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX32Q86XE0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX32Q86XE0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX32Q86XE0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX32Q86XE0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms