Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ALYREFQ86V81 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALYREFQ86V81 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ALYREFQ86V81 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALYREFQ86V81 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ALYREFQ86V81 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ALYREFQ86V81 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALYREFQ86V81 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALYREFQ86V81 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALYREFQ86V81 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALYREFQ86V81 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALYREFQ86V81 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALYREFQ86V81 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALYREFQ86V81 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALYREFQ86V81 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALYREFQ86V81 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALYREFQ86V81 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALYREFQ86V81 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALYREFQ86V81 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALYREFQ86V81 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALYREFQ86V81 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALYREFQ86V81 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALYREFQ86V81 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALYREFQ86V81 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALYREFQ86V81 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALYREFQ86V81 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALYREFQ86V81 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALYREFQ86V81 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ALYREFQ86V81 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALYREFQ86V81 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALYREFQ86V81 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALYREFQ86V81 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALYREFQ86V81 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALYREFQ86V81 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALYREFQ86V81 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALYREFQ86V81 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALYREFQ86V81 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALYREFQ86V81 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALYREFQ86V81 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALYREFQ86V81 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALYREFQ86V81 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALYREFQ86V81 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALYREFQ86V81 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALYREFQ86V81 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALYREFQ86V81 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALYREFQ86V81 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALYREFQ86V81 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALYREFQ86V81 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALYREFQ86V81 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALYREFQ86V81 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALYREFQ86V81 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALYREFQ86V81 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALYREFQ86V81 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ALYREFQ86V81 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALYREFQ86V81 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALYREFQ86V81 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALYREFQ86V81 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALYREFQ86V81 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALYREFQ86V81 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALYREFQ86V81 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALYREFQ86V81 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ALYREFQ86V81 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALYREFQ86V81 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALYREFQ86V81 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALYREFQ86V81 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALYREFQ86V81 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALYREFQ86V81 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALYREFQ86V81 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALYREFQ86V81 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALYREFQ86V81 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALYREFQ86V81 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ALYREFQ86V81 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALYREFQ86V81 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALYREFQ86V81 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALYREFQ86V81 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALYREFQ86V81 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALYREFQ86V81 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALYREFQ86V81 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALYREFQ86V81 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALYREFQ86V81 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALYREFQ86V81 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ALYREFQ86V81 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALYREFQ86V81 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALYREFQ86V81 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ALYREFQ86V81 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ALYREFQ86V81 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALYREFQ86V81 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ALYREFQ86V81 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ALYREFQ86V81 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALYREFQ86V81 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALYREFQ86V81 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALYREFQ86V81 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALYREFQ86V81 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALYREFQ86V81 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALYREFQ86V81 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALYREFQ86V81 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALYREFQ86V81 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALYREFQ86V81 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALYREFQ86V81 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALYREFQ86V81 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms