Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
PBRM1Q86U86 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
PBRM1Q86U86 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40■■■■□ 3.99
PBRM1Q86U86 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
PBRM1Q86U86 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC40■■■■□ 3.99
PBRM1Q86U86 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
PBRM1Q86U86 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
PBRM1Q86U86 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
PBRM1Q86U86 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
PBRM1Q86U86 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC39.99■■■■□ 3.99
PBRM1Q86U86 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
PBRM1Q86U86 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
PBRM1Q86U86 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
PBRM1Q86U86 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC39.97■■■■□ 3.99
PBRM1Q86U86 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
PBRM1Q86U86 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
PBRM1Q86U86 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC39.97■■■■□ 3.99
PBRM1Q86U86 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
PBRM1Q86U86 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC39.96■■■■□ 3.99
PBRM1Q86U86 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
PBRM1Q86U86 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
PBRM1Q86U86 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
PBRM1Q86U86 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
PBRM1Q86U86 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
PBRM1Q86U86 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
PBRM1Q86U86 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
PBRM1Q86U86 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC39.94■■■■□ 3.98
PBRM1Q86U86 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
PBRM1Q86U86 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
PBRM1Q86U86 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC39.93■■■■□ 3.98
PBRM1Q86U86 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC39.93■■■■□ 3.98
PBRM1Q86U86 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC39.92■■■■□ 3.98
PBRM1Q86U86 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC39.92■■■■□ 3.98
PBRM1Q86U86 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC39.92■■■■□ 3.98
PBRM1Q86U86 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC39.92■■■■□ 3.98
PBRM1Q86U86 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
PBRM1Q86U86 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
PBRM1Q86U86 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
PBRM1Q86U86 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
PBRM1Q86U86 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
PBRM1Q86U86 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
PBRM1Q86U86 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
PBRM1Q86U86 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
PBRM1Q86U86 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
PBRM1Q86U86 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC39.89■■■■□ 3.98
PBRM1Q86U86 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.98
PBRM1Q86U86 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
PBRM1Q86U86 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
PBRM1Q86U86 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
PBRM1Q86U86 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC39.86■■■■□ 3.97
PBRM1Q86U86 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
PBRM1Q86U86 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
PBRM1Q86U86 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
PBRM1Q86U86 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
PBRM1Q86U86 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
PBRM1Q86U86 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
PBRM1Q86U86 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
PBRM1Q86U86 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC39.83■■■■□ 3.97
PBRM1Q86U86 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
PBRM1Q86U86 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC39.82■■■■□ 3.96
PBRM1Q86U86 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.96
PBRM1Q86U86 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC39.82■■■■□ 3.96
PBRM1Q86U86 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
PBRM1Q86U86 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
PBRM1Q86U86 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC39.81■■■■□ 3.96
PBRM1Q86U86 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
PBRM1Q86U86 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
PBRM1Q86U86 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC39.8■■■■□ 3.96
PBRM1Q86U86 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
PBRM1Q86U86 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
PBRM1Q86U86 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
PBRM1Q86U86 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
PBRM1Q86U86 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
PBRM1Q86U86 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
PBRM1Q86U86 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC39.79■■■■□ 3.96
PBRM1Q86U86 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
PBRM1Q86U86 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
PBRM1Q86U86 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
PBRM1Q86U86 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
PBRM1Q86U86 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
PBRM1Q86U86 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC39.77■■■■□ 3.96
PBRM1Q86U86 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC39.77■■■■□ 3.96
PBRM1Q86U86 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
PBRM1Q86U86 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC39.76■■■■□ 3.96
PBRM1Q86U86 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC39.76■■■■□ 3.95
PBRM1Q86U86 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
PBRM1Q86U86 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC39.75■■■■□ 3.95
PBRM1Q86U86 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.75■■■■□ 3.95
PBRM1Q86U86 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC39.74■■■■□ 3.95
PBRM1Q86U86 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
PBRM1Q86U86 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC39.74■■■■□ 3.95
PBRM1Q86U86 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC39.74■■■■□ 3.95
PBRM1Q86U86 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.74■■■■□ 3.95
PBRM1Q86U86 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
PBRM1Q86U86 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
PBRM1Q86U86 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
PBRM1Q86U86 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
PBRM1Q86U86 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
PBRM1Q86U86 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
PBRM1Q86U86 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1486.8 ms