Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z403

TMC6, Transmembrane channel-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC6Q7Z403 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMC6Q7Z403 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMC6Q7Z403 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMC6Q7Z403 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMC6Q7Z403 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMC6Q7Z403 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMC6Q7Z403 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMC6Q7Z403 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMC6Q7Z403 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMC6Q7Z403 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMC6Q7Z403 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMC6Q7Z403 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMC6Q7Z403 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMC6Q7Z403 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMC6Q7Z403 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMC6Q7Z403 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMC6Q7Z403 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMC6Q7Z403 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMC6Q7Z403 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMC6Q7Z403 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMC6Q7Z403 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TMC6Q7Z403 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMC6Q7Z403 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMC6Q7Z403 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TMC6Q7Z403 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMC6Q7Z403 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMC6Q7Z403 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMC6Q7Z403 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TMC6Q7Z403 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMC6Q7Z403 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMC6Q7Z403 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMC6Q7Z403 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMC6Q7Z403 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMC6Q7Z403 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMC6Q7Z403 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMC6Q7Z403 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMC6Q7Z403 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMC6Q7Z403 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMC6Q7Z403 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMC6Q7Z403 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMC6Q7Z403 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMC6Q7Z403 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMC6Q7Z403 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMC6Q7Z403 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMC6Q7Z403 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMC6Q7Z403 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMC6Q7Z403 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMC6Q7Z403 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMC6Q7Z403 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMC6Q7Z403 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMC6Q7Z403 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMC6Q7Z403 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMC6Q7Z403 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMC6Q7Z403 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMC6Q7Z403 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMC6Q7Z403 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMC6Q7Z403 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMC6Q7Z403 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMC6Q7Z403 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TMC6Q7Z403 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMC6Q7Z403 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMC6Q7Z403 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TMC6Q7Z403 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMC6Q7Z403 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TMC6Q7Z403 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TMC6Q7Z403 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMC6Q7Z403 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMC6Q7Z403 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMC6Q7Z403 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMC6Q7Z403 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMC6Q7Z403 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMC6Q7Z403 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMC6Q7Z403 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMC6Q7Z403 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMC6Q7Z403 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMC6Q7Z403 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMC6Q7Z403 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMC6Q7Z403 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMC6Q7Z403 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMC6Q7Z403 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMC6Q7Z403 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMC6Q7Z403 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMC6Q7Z403 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMC6Q7Z403 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TMC6Q7Z403 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMC6Q7Z403 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMC6Q7Z403 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMC6Q7Z403 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMC6Q7Z403 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMC6Q7Z403 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMC6Q7Z403 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMC6Q7Z403 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMC6Q7Z403 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMC6Q7Z403 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMC6Q7Z403 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMC6Q7Z403 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMC6Q7Z403 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMC6Q7Z403 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMC6Q7Z403 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMC6Q7Z403 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms