Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP54Q7Z3B4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP54Q7Z3B4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP54Q7Z3B4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP54Q7Z3B4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP54Q7Z3B4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP54Q7Z3B4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP54Q7Z3B4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP54Q7Z3B4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP54Q7Z3B4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP54Q7Z3B4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP54Q7Z3B4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP54Q7Z3B4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP54Q7Z3B4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP54Q7Z3B4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP54Q7Z3B4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP54Q7Z3B4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP54Q7Z3B4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP54Q7Z3B4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP54Q7Z3B4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP54Q7Z3B4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP54Q7Z3B4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP54Q7Z3B4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP54Q7Z3B4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP54Q7Z3B4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP54Q7Z3B4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP54Q7Z3B4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP54Q7Z3B4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP54Q7Z3B4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP54Q7Z3B4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP54Q7Z3B4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP54Q7Z3B4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP54Q7Z3B4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP54Q7Z3B4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP54Q7Z3B4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP54Q7Z3B4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP54Q7Z3B4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP54Q7Z3B4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP54Q7Z3B4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP54Q7Z3B4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP54Q7Z3B4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP54Q7Z3B4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP54Q7Z3B4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NUP54Q7Z3B4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NUP54Q7Z3B4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUP54Q7Z3B4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NUP54Q7Z3B4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NUP54Q7Z3B4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NUP54Q7Z3B4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NUP54Q7Z3B4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP54Q7Z3B4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP54Q7Z3B4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP54Q7Z3B4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP54Q7Z3B4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP54Q7Z3B4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP54Q7Z3B4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP54Q7Z3B4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP54Q7Z3B4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP54Q7Z3B4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP54Q7Z3B4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP54Q7Z3B4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP54Q7Z3B4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP54Q7Z3B4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP54Q7Z3B4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP54Q7Z3B4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP54Q7Z3B4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP54Q7Z3B4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP54Q7Z3B4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP54Q7Z3B4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP54Q7Z3B4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP54Q7Z3B4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP54Q7Z3B4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP54Q7Z3B4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP54Q7Z3B4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP54Q7Z3B4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP54Q7Z3B4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP54Q7Z3B4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP54Q7Z3B4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP54Q7Z3B4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP54Q7Z3B4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP54Q7Z3B4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP54Q7Z3B4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP54Q7Z3B4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NUP54Q7Z3B4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NUP54Q7Z3B4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP54Q7Z3B4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP54Q7Z3B4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP54Q7Z3B4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP54Q7Z3B4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP54Q7Z3B4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP54Q7Z3B4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP54Q7Z3B4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP54Q7Z3B4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP54Q7Z3B4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP54Q7Z3B4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP54Q7Z3B4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP54Q7Z3B4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP54Q7Z3B4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP54Q7Z3B4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP54Q7Z3B4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms