Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PREX2Q70Z35 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PREX2Q70Z35 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PREX2Q70Z35 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PREX2Q70Z35 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PREX2Q70Z35 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
PREX2Q70Z35 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PREX2Q70Z35 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PREX2Q70Z35 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
PREX2Q70Z35 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PREX2Q70Z35 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PREX2Q70Z35 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PREX2Q70Z35 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PREX2Q70Z35 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PREX2Q70Z35 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PREX2Q70Z35 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PREX2Q70Z35 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
PREX2Q70Z35 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
PREX2Q70Z35 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PREX2Q70Z35 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PREX2Q70Z35 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PREX2Q70Z35 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PREX2Q70Z35 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PREX2Q70Z35 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PREX2Q70Z35 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
PREX2Q70Z35 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
PREX2Q70Z35 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
PREX2Q70Z35 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
PREX2Q70Z35 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
PREX2Q70Z35 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC36.83■■■■□ 3.49
PREX2Q70Z35 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
PREX2Q70Z35 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
PREX2Q70Z35 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.49
PREX2Q70Z35 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
PREX2Q70Z35 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
PREX2Q70Z35 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PREX2Q70Z35 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PREX2Q70Z35 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PREX2Q70Z35 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PREX2Q70Z35 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PREX2Q70Z35 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PREX2Q70Z35 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PREX2Q70Z35 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC36.79■■■■□ 3.48
PREX2Q70Z35 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PREX2Q70Z35 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PREX2Q70Z35 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
PREX2Q70Z35 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PREX2Q70Z35 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
PREX2Q70Z35 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PREX2Q70Z35 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC36.77■■■■□ 3.48
PREX2Q70Z35 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PREX2Q70Z35 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
PREX2Q70Z35 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
PREX2Q70Z35 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
PREX2Q70Z35 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PREX2Q70Z35 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
PREX2Q70Z35 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PREX2Q70Z35 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PREX2Q70Z35 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PREX2Q70Z35 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PREX2Q70Z35 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PREX2Q70Z35 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
PREX2Q70Z35 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PREX2Q70Z35 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
PREX2Q70Z35 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
PREX2Q70Z35 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PREX2Q70Z35 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
PREX2Q70Z35 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
PREX2Q70Z35 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC36.72■■■■□ 3.47
PREX2Q70Z35 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PREX2Q70Z35 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PREX2Q70Z35 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PREX2Q70Z35 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PREX2Q70Z35 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PREX2Q70Z35 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PREX2Q70Z35 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
PREX2Q70Z35 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PREX2Q70Z35 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PREX2Q70Z35 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
PREX2Q70Z35 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PREX2Q70Z35 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PREX2Q70Z35 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
PREX2Q70Z35 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
PREX2Q70Z35 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
PREX2Q70Z35 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
PREX2Q70Z35 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
PREX2Q70Z35 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
PREX2Q70Z35 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PREX2Q70Z35 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PREX2Q70Z35 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PREX2Q70Z35 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PREX2Q70Z35 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PREX2Q70Z35 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
PREX2Q70Z35 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PREX2Q70Z35 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PREX2Q70Z35 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PREX2Q70Z35 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PREX2Q70Z35 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PREX2Q70Z35 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PREX2Q70Z35 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195.5 ms