Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWH5

NEK10, Serine/threonine-protein kinase Nek10, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK10Q6ZWH5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEK10Q6ZWH5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEK10Q6ZWH5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NEK10Q6ZWH5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEK10Q6ZWH5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEK10Q6ZWH5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEK10Q6ZWH5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEK10Q6ZWH5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEK10Q6ZWH5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEK10Q6ZWH5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEK10Q6ZWH5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEK10Q6ZWH5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEK10Q6ZWH5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEK10Q6ZWH5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEK10Q6ZWH5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEK10Q6ZWH5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEK10Q6ZWH5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEK10Q6ZWH5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEK10Q6ZWH5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEK10Q6ZWH5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEK10Q6ZWH5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NEK10Q6ZWH5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NEK10Q6ZWH5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEK10Q6ZWH5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEK10Q6ZWH5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEK10Q6ZWH5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEK10Q6ZWH5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEK10Q6ZWH5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEK10Q6ZWH5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEK10Q6ZWH5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEK10Q6ZWH5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEK10Q6ZWH5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEK10Q6ZWH5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEK10Q6ZWH5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEK10Q6ZWH5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEK10Q6ZWH5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEK10Q6ZWH5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEK10Q6ZWH5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NEK10Q6ZWH5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEK10Q6ZWH5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEK10Q6ZWH5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEK10Q6ZWH5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEK10Q6ZWH5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEK10Q6ZWH5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEK10Q6ZWH5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEK10Q6ZWH5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEK10Q6ZWH5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEK10Q6ZWH5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEK10Q6ZWH5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEK10Q6ZWH5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEK10Q6ZWH5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEK10Q6ZWH5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEK10Q6ZWH5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEK10Q6ZWH5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEK10Q6ZWH5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEK10Q6ZWH5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEK10Q6ZWH5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEK10Q6ZWH5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEK10Q6ZWH5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEK10Q6ZWH5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEK10Q6ZWH5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEK10Q6ZWH5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NEK10Q6ZWH5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEK10Q6ZWH5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEK10Q6ZWH5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEK10Q6ZWH5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEK10Q6ZWH5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEK10Q6ZWH5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEK10Q6ZWH5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEK10Q6ZWH5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEK10Q6ZWH5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEK10Q6ZWH5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEK10Q6ZWH5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEK10Q6ZWH5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEK10Q6ZWH5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEK10Q6ZWH5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEK10Q6ZWH5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEK10Q6ZWH5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEK10Q6ZWH5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEK10Q6ZWH5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NEK10Q6ZWH5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NEK10Q6ZWH5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEK10Q6ZWH5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEK10Q6ZWH5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NEK10Q6ZWH5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEK10Q6ZWH5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NEK10Q6ZWH5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEK10Q6ZWH5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEK10Q6ZWH5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEK10Q6ZWH5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEK10Q6ZWH5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEK10Q6ZWH5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEK10Q6ZWH5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEK10Q6ZWH5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEK10Q6ZWH5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEK10Q6ZWH5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEK10Q6ZWH5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NEK10Q6ZWH5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEK10Q6ZWH5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEK10Q6ZWH5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms