Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC149Q6ZUS6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC149Q6ZUS6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC149Q6ZUS6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC149Q6ZUS6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC149Q6ZUS6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC149Q6ZUS6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC149Q6ZUS6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC149Q6ZUS6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC149Q6ZUS6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC149Q6ZUS6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC149Q6ZUS6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC149Q6ZUS6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC149Q6ZUS6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC149Q6ZUS6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC149Q6ZUS6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC149Q6ZUS6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC149Q6ZUS6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC149Q6ZUS6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC149Q6ZUS6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC149Q6ZUS6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC149Q6ZUS6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC149Q6ZUS6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC149Q6ZUS6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC149Q6ZUS6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC149Q6ZUS6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC149Q6ZUS6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC149Q6ZUS6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC149Q6ZUS6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC149Q6ZUS6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC149Q6ZUS6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC149Q6ZUS6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC149Q6ZUS6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC149Q6ZUS6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC149Q6ZUS6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC149Q6ZUS6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC149Q6ZUS6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC149Q6ZUS6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC149Q6ZUS6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC149Q6ZUS6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC149Q6ZUS6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC149Q6ZUS6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC149Q6ZUS6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC149Q6ZUS6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC149Q6ZUS6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC149Q6ZUS6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC149Q6ZUS6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC149Q6ZUS6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC149Q6ZUS6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC149Q6ZUS6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC149Q6ZUS6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC149Q6ZUS6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC149Q6ZUS6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC149Q6ZUS6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC149Q6ZUS6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC149Q6ZUS6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC149Q6ZUS6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC149Q6ZUS6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC149Q6ZUS6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC149Q6ZUS6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC149Q6ZUS6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC149Q6ZUS6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC149Q6ZUS6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC149Q6ZUS6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC149Q6ZUS6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC149Q6ZUS6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC149Q6ZUS6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC149Q6ZUS6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC149Q6ZUS6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC149Q6ZUS6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC149Q6ZUS6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC149Q6ZUS6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC149Q6ZUS6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC149Q6ZUS6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC149Q6ZUS6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC149Q6ZUS6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC149Q6ZUS6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC149Q6ZUS6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC149Q6ZUS6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC149Q6ZUS6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC149Q6ZUS6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC149Q6ZUS6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC149Q6ZUS6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC149Q6ZUS6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC149Q6ZUS6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC149Q6ZUS6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC149Q6ZUS6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC149Q6ZUS6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC149Q6ZUS6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC149Q6ZUS6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC149Q6ZUS6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC149Q6ZUS6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC149Q6ZUS6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC149Q6ZUS6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC149Q6ZUS6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC149Q6ZUS6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC149Q6ZUS6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC149Q6ZUS6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC149Q6ZUS6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC149Q6ZUS6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms