Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNE9

RUFY4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY4Q6ZNE9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RUFY4Q6ZNE9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RUFY4Q6ZNE9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RUFY4Q6ZNE9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RUFY4Q6ZNE9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RUFY4Q6ZNE9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RUFY4Q6ZNE9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RUFY4Q6ZNE9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RUFY4Q6ZNE9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RUFY4Q6ZNE9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RUFY4Q6ZNE9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RUFY4Q6ZNE9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RUFY4Q6ZNE9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RUFY4Q6ZNE9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RUFY4Q6ZNE9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RUFY4Q6ZNE9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RUFY4Q6ZNE9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUFY4Q6ZNE9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUFY4Q6ZNE9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUFY4Q6ZNE9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUFY4Q6ZNE9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUFY4Q6ZNE9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUFY4Q6ZNE9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUFY4Q6ZNE9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUFY4Q6ZNE9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUFY4Q6ZNE9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RUFY4Q6ZNE9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RUFY4Q6ZNE9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RUFY4Q6ZNE9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RUFY4Q6ZNE9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RUFY4Q6ZNE9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RUFY4Q6ZNE9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUFY4Q6ZNE9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUFY4Q6ZNE9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUFY4Q6ZNE9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUFY4Q6ZNE9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUFY4Q6ZNE9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUFY4Q6ZNE9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUFY4Q6ZNE9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUFY4Q6ZNE9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RUFY4Q6ZNE9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RUFY4Q6ZNE9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RUFY4Q6ZNE9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RUFY4Q6ZNE9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RUFY4Q6ZNE9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RUFY4Q6ZNE9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RUFY4Q6ZNE9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RUFY4Q6ZNE9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RUFY4Q6ZNE9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RUFY4Q6ZNE9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RUFY4Q6ZNE9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RUFY4Q6ZNE9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RUFY4Q6ZNE9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RUFY4Q6ZNE9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RUFY4Q6ZNE9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RUFY4Q6ZNE9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
RUFY4Q6ZNE9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RUFY4Q6ZNE9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RUFY4Q6ZNE9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RUFY4Q6ZNE9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RUFY4Q6ZNE9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RUFY4Q6ZNE9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RUFY4Q6ZNE9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RUFY4Q6ZNE9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RUFY4Q6ZNE9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RUFY4Q6ZNE9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RUFY4Q6ZNE9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RUFY4Q6ZNE9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RUFY4Q6ZNE9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RUFY4Q6ZNE9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RUFY4Q6ZNE9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RUFY4Q6ZNE9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RUFY4Q6ZNE9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RUFY4Q6ZNE9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RUFY4Q6ZNE9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUFY4Q6ZNE9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUFY4Q6ZNE9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUFY4Q6ZNE9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUFY4Q6ZNE9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUFY4Q6ZNE9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUFY4Q6ZNE9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUFY4Q6ZNE9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUFY4Q6ZNE9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUFY4Q6ZNE9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RUFY4Q6ZNE9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUFY4Q6ZNE9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUFY4Q6ZNE9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RUFY4Q6ZNE9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RUFY4Q6ZNE9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RUFY4Q6ZNE9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RUFY4Q6ZNE9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RUFY4Q6ZNE9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RUFY4Q6ZNE9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RUFY4Q6ZNE9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RUFY4Q6ZNE9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RUFY4Q6ZNE9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUFY4Q6ZNE9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUFY4Q6ZNE9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUFY4Q6ZNE9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUFY4Q6ZNE9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms